69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0809 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0809  transposase  100 
 
 
153 aa  314  3e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  59.33 
 
 
152 aa  196  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  52.94 
 
 
153 aa  188  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  53.95 
 
 
153 aa  188  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  49.02 
 
 
153 aa  176  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  49.02 
 
 
153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  48.67 
 
 
156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  45.33 
 
 
153 aa  157  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  39.73 
 
 
148 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  42.11 
 
 
159 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  33.8 
 
 
144 aa  103  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  34 
 
 
149 aa  94  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  34.85 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  36.43 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  28.67 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  32.54 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  28.99 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  31.62 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  34.69 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  32.91 
 
 
137 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1440  transposase  50 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431029  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  26.23 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  24.78 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  25.21 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  30.7 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  25.21 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  26.89 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  26.89 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  26.89 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  26.89 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  26.89 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  26.89 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  26.89 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  21.26 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  35.53 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  21.26 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  21.26 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  19.33 
 
 
315 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  21.26 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  21.31 
 
 
142 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  24.14 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4520  transposase IS200  26.67 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  25.2 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  25.2 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  25.2 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  26.61 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  23.02 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  22.05 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  23.14 
 
 
142 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  24 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  24 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  20.47 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  20.47 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  20.47 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>