196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5788 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  100 
 
 
153 aa  320  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  60.53 
 
 
153 aa  214  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  65.36 
 
 
153 aa  214  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  54.61 
 
 
152 aa  196  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  58 
 
 
156 aa  193  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  54.9 
 
 
153 aa  185  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  53.33 
 
 
153 aa  184  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  49.02 
 
 
153 aa  176  7e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  39.73 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  36 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  39.42 
 
 
144 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  44.74 
 
 
159 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  37.93 
 
 
147 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  37.86 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  34.31 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  39.69 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  32.59 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  32.58 
 
 
134 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  34.43 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  29.46 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  39.76 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  28.93 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  28.93 
 
 
137 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  28.93 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  28.57 
 
 
315 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  27.87 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  28.93 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2126  transposase IS200-family protein  30.16 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3913  transposase IS200-family protein  30.16 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0368355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3938  transposase IS200-family protein  30.16 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00130774  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
137 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  26.89 
 
 
175 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  31.3 
 
 
156 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  30.51 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1440  transposase  43.1 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431029  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  30.7 
 
 
126 aa  55.1  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  30.7 
 
 
126 aa  55.1  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  30.7 
 
 
126 aa  55.1  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  26.45 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  28.46 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  26.45 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  28.57 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  28.57 
 
 
146 aa  53.9  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  26.5 
 
 
136 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  27.97 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  29.57 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  29.57 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  25.86 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  34.38 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  27.91 
 
 
137 aa  50.4  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  31.65 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  23.2 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  24.79 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  27.42 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0445  transposase  29.93 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.713424  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0631  transposase  29.93 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  35.06 
 
 
160 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  29.93 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  29.93 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  27.59 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1731  transposase IS200-family protein  26.58 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.316539  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1583  transposase IS200-family protein  26.58 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0461624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0888  transposase IS200-family protein  26.58 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  23.39 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  29.06 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  26.27 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  26.27 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  26.27 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  26.27 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  26.27 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  26.27 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  26.27 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  27.83 
 
 
151 aa  48.9  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0497  transposase IS200-family protein  27.63 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.254331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1464  hypothetical protein  39.19 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  25.41 
 
 
139 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  25.41 
 
 
139 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>