More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0733 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  100 
 
 		 137 aa  287  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  82.35 
 
 		 137 aa  238  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  40.16 
 
 		 134 aa  120  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  34.35 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  31.5 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  30.65 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  29.01 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  29.55 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  28.68 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  32.48 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  29.1 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  32.87 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  29.46 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  34.69 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  27.91 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  28.89 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  29.32 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  33.73 
 
 		 159 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  33.62 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  29.32 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  29.32 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  35.59 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3775  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  hitchhiker  0.00122355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2752  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142514  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3987  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2737  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00976061  hitchhiker  0.000421272 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2692  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000019041  normal  0.177114 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2237  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  hitchhiker  0.00146624 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2564  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.87353  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1034  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0470  transposase IS200-family protein  29.03 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  31.4 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  31.4 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  30.63 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2336  transposase IS200-family protein  31.4 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00527221  hitchhiker  0.00384725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  31.67 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4507  transposase IS200-like  32.31 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  32.38 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  30.33 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  30.33 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  34.75 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1682  transposase IS200-family protein  32.03 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  34.75 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  29.84 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  31.93 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  31.15 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  28.1 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2466  transposase IS200-family protein  29.63 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000294883  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0751  IS1004 transposase  29.75 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.627984  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0956  IS1004 transposase  29.75 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0130063  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1025  IS1004 transposase  29.75 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0396  IS1004 transposase  29.75 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1777  IS1004 transposase  29.75 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140938  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  26.36 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  26.09 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  26.09 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  26.09 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  26.09 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  26.09 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  26.09 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  26.09 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  29.91 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  30.08 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4597  transposase IS200-like  33.06 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1800  ISCps10, transposase  32.71 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.715087  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  30.58 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  28.23 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  22.14 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  30.33 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1220  IS1004 transposase  29.55 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  37.04 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  37.04 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2186  transposase IS200-family protein  29.2 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0145816  hitchhiker  0.0000471313 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0990  transposase IS200-family protein  29.82 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0779  transposase IS200-family protein  27.05 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0574  transposase IS200-family protein  28.95 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0027  transposase  31.09 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.922302 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  29.73 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  29.06 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  29.06 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  29.06 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  27.03 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  27.03 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  27.42 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0149  transposase IS200-family protein  28.95 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.225581  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  27.03 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  27.03 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  29.46 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  27.42 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  27.73 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  27.73 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2146  IS1004 transposase  28.93 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000124664  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  29.06 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  28.1 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>