258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4541 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  100 
 
 
148 aa  308  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  44.52 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  42.86 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  39.73 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  41.78 
 
 
153 aa  116  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  39.73 
 
 
156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  39.73 
 
 
153 aa  115  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  36.55 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  39.73 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  40.82 
 
 
149 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  36.57 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  33.63 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  34.97 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  32.87 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  31.65 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  33.81 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  31.29 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  30.5 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  29.66 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  28.69 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  29.06 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  26.27 
 
 
133 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  26.27 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  32.94 
 
 
139 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  32.94 
 
 
139 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  32.94 
 
 
139 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  29.66 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  32.14 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  28.57 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  32 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  32.14 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  32.14 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  27.12 
 
 
315 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  32.14 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  28.81 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  27.73 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  27.97 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  27.97 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  27.97 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  27.97 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  25.42 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  27.97 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  27.97 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  27.97 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  32.43 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  25.71 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  26.5 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5522  IS element transposase  25.64 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  27.42 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4520  transposase IS200  31.08 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  25.83 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  27.05 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  26.45 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  26.05 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  28.87 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  25.42 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  24.14 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  32.43 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  23.08 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  24.37 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  26.02 
 
 
136 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  26.83 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  26.27 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  26.89 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  26.89 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  26.27 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  26.27 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  25.6 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  25.6 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  25.6 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  25.6 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  25.6 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  25.6 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  25.6 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  31.36 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1693  transposase IS200-family protein  24.14 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.217342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  32.47 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  32.47 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  32.47 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2843  transposase IS200-family protein  24.44 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.654156  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3488  transposase IS200-family protein  27.87 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504027  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  28.45 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>