More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1468 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  100 
 
 		 137 aa  287  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  82.35 
 
 		 137 aa  238  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  41.73 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  37.4 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  32.28 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  34.68 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  84.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  32.8 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  34.51 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  31.65 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  27.42 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  39.76 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  28.23 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  32.91 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  27.42 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  27.48 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  31.36 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  27.64 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  29.47 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  30.65 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  30.65 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4105  transposase IS200-family protein  34.75 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  30.58 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  30.25 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  32.76 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2929  transposase IS200-family protein  33.61 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3365  transposase IS200-family protein  33.61 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  30.53 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  30.53 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  30.53 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  30.53 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  30.53 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  30.53 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  30.53 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0718  transposase IS200-family protein  28.24 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000304427  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2359  transposase IS200-family protein  28.24 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00152656  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4874  transposase  26.12 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.110034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2658  transposase  26.12 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81443  hitchhiker  0.00656251 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1045  transposase  26.12 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1356  transposase  26.12 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.307018 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3900  transposase IS200-family protein  29.41 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1529  transposase IS200-family protein  29.41 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2222  transposase IS200-family protein  26.12 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2857  transposase IS200-family protein  32.38 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.999243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2487  transposase IS200-family protein  30 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  29.6 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  23.66 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  31.17 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  29.47 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2321  transposase IS200-family protein  28.21 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.541219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  29.47 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  27.03 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  29.47 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  30.53 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0477  transposase for IS200  30.11 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4507  transposase IS200-like  31.97 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0472211 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  26.02 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3010  transposase IS200-family protein  27.48 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254942  normal  0.0411213 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1527  transposase IS200-family protein  27.48 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.538316  hitchhiker  0.000748783 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  26.02 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2519  transposase IS200-family protein  24.81 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  30.53 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1083  transposase IS200-family protein  28.46 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3413  IS1541, transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3224  IS1541, transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3858  IS1541, transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3506  transposase IS200-family protein  25.37 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00621529  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3905  IS1541, transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000085189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1100  IS1541 transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0050  IS1541 transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0029  IS1541 transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0786  IS1541 transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.282171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1993  IS1541 transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0680  IS1541 transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2631  transposase IS200-family protein  25.37 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000741775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1679  transposase IS200-family protein  25.37 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3488  transposase IS200-family protein  25.37 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1725  IS1541, transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.72362  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2543  IS1541, transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.8293000000000004e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0846  transposase IS200-family protein  25.37 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0279  transposase IS200-family protein  25.37 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000713801  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2889  transposase IS200-family protein  25.37 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2234  transposase IS200-family protein  25.37 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.893496  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3209  transposase IS200-family protein  25.37 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000115009  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2533  transposase IS200-family protein  25.37 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0181  IS1541, transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0496  IS1541, transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1673  IS1541, transposase  25 
 
 		 169 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00131139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>