139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4683 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  100 
 
 
153 aa  319  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  66 
 
 
156 aa  216  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  65.36 
 
 
153 aa  214  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  61.18 
 
 
153 aa  206  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  59.87 
 
 
152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  54 
 
 
153 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  55.33 
 
 
153 aa  179  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  49.02 
 
 
153 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  44.52 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  45.61 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  39.31 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  35.33 
 
 
149 aa  103  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  36.17 
 
 
144 aa  101  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  37.41 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  31.65 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  36.05 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  36.07 
 
 
134 aa  87.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  35.61 
 
 
134 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  31.06 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  27.91 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4520  transposase IS200  32.23 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  27.48 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  29.6 
 
 
140 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  26.05 
 
 
315 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  27.87 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  24.19 
 
 
175 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  25.62 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  27.73 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  25.62 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2203  transposase IS200-family protein  27.12 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  27.73 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  28.81 
 
 
134 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  28.95 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  30.09 
 
 
156 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  26.05 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1440  transposase  40.98 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431029  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  24.78 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  25.83 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1021  transposase IS200-family protein  27.93 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  25.42 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  25.78 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  25.78 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  24 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  28.83 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  26.72 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  25.77 
 
 
166 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  26.74 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  24.6 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  24.6 
 
 
137 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  23.97 
 
 
142 aa  47  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  24.6 
 
 
138 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  23.77 
 
 
137 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  26.83 
 
 
135 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  28.21 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  28.21 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  23.97 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  25.2 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  28.21 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  28.21 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  28.21 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  24.41 
 
 
134 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  26.61 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  25.86 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1678  transposase IS200-family protein  28.46 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  29.33 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  29.33 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  24.39 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1776  hypothetical protein  30.43 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0173  transposase IS200-family protein  25.62 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1431  transposase IS200-family protein  25.62 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2799  transposase IS200-family protein  25.62 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  23.02 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  23.02 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  23.97 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  29.06 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1768  hypothetical protein  29.57 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.3207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  23.02 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  29.06 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  29.06 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  29.06 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  29.06 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  29.06 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  29.06 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  26.36 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  22.4 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  25.18 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  25.18 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>