88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0236 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0236  transposase  100 
 
 		 153 aa  320  5e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  57.33 
 
 		 152 aa  190  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  52.94 
 
 		 153 aa  188  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  53.33 
 
 		 153 aa  184  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  55.33 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  52.67 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  54 
 
 		 156 aa  174  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  43.33 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  44.22 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  41.78 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  39.42 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  38.94 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  35.56 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  34.53 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  40.48 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  40.16 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  32.33 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  37.06 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  30.22 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  28.89 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  27.42 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2203  transposase IS200-family protein  27.5 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2841  transposase IS200-family protein  25 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1440  transposase  46.43 
 
 		 67 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2570  transposase IS200-family protein  25 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  25.21 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  27.97 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  25.6 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  30.25 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  30.25 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  30.25 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  30.25 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  30.25 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  30.25 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  30.25 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  26.96 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  22.31 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  23.77 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  28.32 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  29.13 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0393  transposase IS200-family protein  31.53 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  23.53 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  27.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  23.53 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  26.27 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  23.77 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  23.08 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3227  transposase IS200-family protein  25.89 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1129  transposase IS200-family protein  25.89 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  22.69 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  31.15 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  25 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  22.76 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5481  transposase IS200-family protein  25.83 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675618  normal  0.728721 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  22.76 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  23.14 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  23.08 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2645  transposase IS200-family protein  31.58 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  21.37 
 
 		 130 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  27.84 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  25.32 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  23.53 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  23.08 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  29.33 
 
 		 156 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  23.53 
 
 		 146 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  25.44 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4520  transposase IS200  27.17 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  22.32 
 
 		 136 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0387  transposase IS200  28.95 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  30.33 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  25.22 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  25.44 
 
 		 187 aa  40.8  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  22.61 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  28 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  29.17 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>