100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4813 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4813  transposase IS200-family protein  100 
 
 
153 aa  323  5e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259352  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2186  transposase IS200-family protein  59.33 
 
 
153 aa  202  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.327119  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4151  transposase IS200-family protein  56.58 
 
 
156 aa  192  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4683  transposase IS200-family protein  54 
 
 
153 aa  187  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372329  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5788  transposase IS200-family protein  54.9 
 
 
153 aa  185  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0791581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0951  transposase IS200-family protein  50 
 
 
152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0809  transposase  45.33 
 
 
153 aa  157  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447817  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0236  transposase  43.33 
 
 
153 aa  149  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.172698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4541  transposase IS200-like protein  36.55 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4391  hypothetical protein  41.23 
 
 
159 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1441  transposase  33.78 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0836409  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2540  transposase IS200-family protein  41.3 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0740885  hitchhiker  0.00460765 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2353  transposase  35.04 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.404204  normal  0.0913355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1803  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  92.8  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.825711  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0904  hypothetical protein  35.04 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.551236  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0379  transposase  34.78 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0100785  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0088  hypothetical protein  34.53 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1327  transposase IS200  36.89 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3250  transposase IS200-family protein  35.66 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1468  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.817546  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0733  transposase IS200-family protein  26.36 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1583  transposase IS200-family protein  27.64 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439761  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5478  transposase IS200-family protein  26.02 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.437745  normal  0.68809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0876  transposase IS200-family protein  24.79 
 
 
133 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0101  transposase IS200  23.02 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  28.07 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1440  transposase  41.07 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431029  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1367  transposase IS200-family protein  25 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.434428  normal  0.591867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0839  transposase IS200-family protein  25 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1599  transposase IS200-family protein  25 
 
 
138 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6350  transposase IS200  25.2 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2602  transposase IS200-family protein  24.64 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000886257  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2942  IS1004 transposase  24.64 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0661505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3464  IS1004 transposase  24.64 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2412  IS1004 transposase  24.64 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1318  IS1004 transposase  24.64 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.878127  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0918  IS1004 transposase  24.64 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000517602  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0596  IS1004 transposase  24.64 
 
 
148 aa  47.4  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0667135  normal  0.0252158 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4642  transposase IS200-family protein  24.6 
 
 
137 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  22.69 
 
 
315 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1134  transposase-related protein  26.23 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1323  transposase-related protein  26.23 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.316978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  22.69 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3832  transposase IS200-family protein  30.1 
 
 
200 aa  45.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3266  transposase IS200-family protein  24.79 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000454632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2231  transposase IS200-family protein  24.79 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0748  transposase IS200-family protein  24.79 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000554025  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2133  transposase IS200-family protein  24.79 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000517117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1668  transposase IS200-family protein  24.79 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1820  transposase IS200-family protein  24.79 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  22.13 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2108  transposase IS200-family protein  24.79 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1561  IS1004 transposase  25.32 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.70736  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1411  transposase IS200-family protein  23.33 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1338  transposase IS200-family protein  23.33 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0587  transposase IS200-family protein  23.33 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3796  transposase IS200  23.58 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4523  transposase IS200-family protein  23.33 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.998354  normal  0.81056 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  25.21 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  25 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  26.5 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3579  transposase IS200-family protein  25.62 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2998  transposase IS200-family protein  25.81 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000570357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3184  transposase IS200-family protein  24.19 
 
 
134 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4520  transposase IS200  24.76 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  22.5 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1432  transposase IS200-like protein  27.18 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0977  transposase IS200-family protein  25.64 
 
 
152 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  23.28 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  23.28 
 
 
155 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1928  transposase IS200-family protein  23.93 
 
 
136 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1189  transposase  27.38 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  25.19 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2638  transposase  28.4 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00248173  normal  0.153291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  25.19 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2595  transposase  27.38 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0602972  normal  0.532476 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0631  transposase  27.38 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0445  transposase  27.38 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.713424  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0653  transposase  28.4 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3301  transposase IS200-family protein  23.28 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  21.85 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2031  transposase IS200-like protein  26.21 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000295785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1427  transposase IS200-family protein  20.97 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  28.18 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  25.19 
 
 
149 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  23.73 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11260  transposase  24.35 
 
 
151 aa  40  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  23.14 
 
 
137 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>