More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1653 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  530  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0706  hypothetical protein  36.03 
 
 
272 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1076  protein of unknown function DUF152  35.77 
 
 
273 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0061  hypothetical protein  38.52 
 
 
255 aa  159  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.102372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  39.08 
 
 
267 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  38.78 
 
 
267 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  38.04 
 
 
265 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  34.34 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  34.34 
 
 
266 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09200  conserved hypothetical protein TIGR00726  36.33 
 
 
268 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000514042  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0117  hypothetical protein  37.25 
 
 
270 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0615841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  37.39 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  37.39 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  37.96 
 
 
252 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  33.07 
 
 
275 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  35.63 
 
 
252 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  35.8 
 
 
252 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1420  hypothetical protein  34.96 
 
 
277 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.331638  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  34.73 
 
 
244 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  35.44 
 
 
263 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  35.42 
 
 
253 aa  142  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  33.2 
 
 
293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  38.43 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0911  hypothetical protein  34.82 
 
 
279 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  32.42 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  36.24 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2254  hypothetical protein  36.36 
 
 
264 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57305  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  33.98 
 
 
256 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2251  protein of unknown function DUF152  37.74 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2510  protein of unknown function DUF152  32.78 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2101  hypothetical protein  35.38 
 
 
263 aa  133  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.477366  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  31.97 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4799  protein of unknown function DUF152  33.19 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0186772 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2494  protein of unknown function DUF152  35 
 
 
251 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00420427  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3530  protein of unknown function DUF152  33.06 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  34.48 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  34.08 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2888  protein of unknown function DUF152  32.37 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000159444  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2152  hypothetical protein  35.06 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144936  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  33.95 
 
 
259 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  33.76 
 
 
258 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  34.51 
 
 
276 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1345  hypothetical protein  32.06 
 
 
265 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0261  hypothetical protein  36.23 
 
 
255 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.270785  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  32.62 
 
 
257 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  34.01 
 
 
241 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  32.67 
 
 
272 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  32.91 
 
 
256 aa  122  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  34.22 
 
 
272 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  31.28 
 
 
255 aa  122  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  31.28 
 
 
255 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  32.74 
 
 
255 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  31.3 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0607  protein of unknown function DUF152  29.96 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  33.6 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3013  protein of unknown function DUF152  35.56 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  31.33 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0618  hypothetical protein  35.24 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.506998  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  32.6 
 
 
264 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  32.46 
 
 
270 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2085  protein of unknown function DUF152  32.37 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000113005  decreased coverage  0.0000000000000053007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  30.77 
 
 
256 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0213  hypothetical protein  34.9 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  33.18 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  34.65 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  34.23 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  32.61 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  33.74 
 
 
244 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2224  protein of unknown function DUF152  35.96 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2642  protein of unknown function DUF152  34.73 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1643  hypothetical protein  31 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1637  hypothetical protein  34.19 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3519  hypothetical protein  32.9 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00355999  normal  0.0410879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1816  hypothetical protein  30.29 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.570044 
 
 
-
 
NC_004310  BR1530  hypothetical protein  33.04 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  30.59 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  30.59 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1479  hypothetical protein  33.04 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0106997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  32 
 
 
255 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  30.58 
 
 
299 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0152  protein of unknown function DUF152  29.58 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  30.77 
 
 
255 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27360  conserved hypothetical protein TIGR00726  32.77 
 
 
234 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  29.8 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3271  hypothetical protein  32.61 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  31.42 
 
 
253 aa  112  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  30.33 
 
 
248 aa  112  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  30.74 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0476  hypothetical protein  31.28 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  29.8 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  29.8 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0643  hypothetical protein  31.08 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0890735  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.8 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2011  hypothetical protein  35.75 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  34.8 
 
 
248 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  30.2 
 
 
269 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  31.95 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  32.92 
 
 
254 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>