174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1505 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1505  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  177  4.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000185503  normal  0.10684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3071  hypothetical protein  52.54 
 
 		 446 aa  73.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0195173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.45 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6823  RND family efflux transporter MFP subunit  41.27 
 
 		 485 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  67.57 
 
 		 451 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  43.06 
 
 		 404 aa  61.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3074  heavy metal translocating P-type ATPase  51.72 
 
 		 845 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6878  RND family efflux transporter MFP subunit  67.74 
 
 		 473 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1502  component of copper transport system  44.83 
 
 		 417 aa  60.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000118001  normal  0.0300718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0129  Ni Fe-hydrogenase III large subunit-like protein  55 
 
 		 540 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  67.57 
 
 		 837 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  63.16 
 
 		 841 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903237  normal  0.0729123 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.86 
 
 		 607 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.537519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7156  heavy metal translocating P-type ATPase  63.16 
 
 		 841 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.802165 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  40.28 
 
 		 472 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  65.62 
 
 		 846 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563688  normal  0.39359 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0180  copper-translocating P-type ATPase  55.56 
 
 		 801 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3603  heavy metal translocating P-type ATPase  53.49 
 
 		 781 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.385449 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3941  heavy metal translocating P-type ATPase  53.49 
 
 		 781 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3384  Fis family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0864  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.77 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0385  heavy metal translocating P-type ATPase  56.41 
 
 		 729 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1223  heavy metal translocating P-type ATPase  55 
 
 		 721 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1935  copper-translocating P-type ATPase  53.33 
 
 		 822 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3854  copper-transporting ATPase domain-containing protein  38.75 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11723  heavy-metal transporting P-type ATPase  70 
 
 		 835 aa  55.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0439709  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0986  heavy metal translocating P-type ATPase  80 
 
 		 810 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.54 
 
 		 627 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  66.67 
 
 		 455 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1779  secretion protein HlyD  33.82 
 
 		 427 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0975048  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11368  heavy-metal transporting P-type ATPase  70.97 
 
 		 824 aa  55.1  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2667  heavy metal translocating P-type ATPase  69.7 
 
 		 846 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.81 
 
 		 465 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3981  copper-transporting ATPase domain-containing protein  35.44 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1596  hypothetical protein  44.62 
 
 		 735 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1712  cation transporting P-type ATPase  72.41 
 
 		 767 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  56.82 
 
 		 509 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6824  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 627 aa  53.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 809 aa  53.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  48.89 
 
 		 466 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.81 
 
 		 456 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2005  heavy metal translocating P-type ATPase  73.08 
 
 		 753 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0148  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 730 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5360  heavy metal translocating P-type ATPase  83.33 
 
 		 797 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.647165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4394  heavy metal translocating P-type ATPase  60 
 
 		 715 aa  52.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3066  hypothetical protein  41.18 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.254164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  57.5 
 
 		 468 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4100  heavy metal translocating P-type ATPase  58.06 
 
 		 785 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0322653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4596  copper-transporting ATPase domain-containing protein  40.91 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.52 
 
 		 526 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6119  copper efflux ATPase CopF  75 
 
 		 805 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.161419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3781  copper-transporting ATPase domain-containing protein  37.97 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  77.78 
 
 		 514 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1469  heavy metal translocating P-type ATPase  63.89 
 
 		 777 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1645  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  79.17 
 
 		 744 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.321264 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  77.78 
 
 		 513 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  64.52 
 
 		 512 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2191  heavy metal translocating P-type ATPase  79.17 
 
 		 780 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  46.51 
 
 		 761 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  77.78 
 
 		 513 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.09 
 
 		 513 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  48.89 
 
 		 500 aa  51.6  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  70.97 
 
 		 502 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0268  hypothetical protein  39.13 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  53.49 
 
 		 815 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 762 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0446  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 826 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 736 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  43.75 
 
 		 871 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.37 
 
 		 568 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0418  heavy metal translocating P-type ATPase  79.17 
 
 		 816 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 851 aa  51.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  53.49 
 
 		 815 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 746 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1258  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 778 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.123345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2710  heavy metal translocating P-type ATPase  79.17 
 
 		 835 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.3034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  53.49 
 
 		 815 aa  51.6  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4547  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 798 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.291191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 		 457 aa  50.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1804  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 806 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.75515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2554  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 786 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00876306 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  51.22 
 
 		 527 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  53.12 
 
 		 504 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  74.07 
 
 		 640 aa  50.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2110  heavy metal translocating P-type ATPase  46.15 
 
 		 776 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0164  hypothetical protein  35.9 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3972  heavy metal translocating P-type ATPase  48.78 
 
 		 782 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16922  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  55.88 
 
 		 826 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2267  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  54.55 
 
 		 772 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.270801  normal  0.567344 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1178  heavy metal translocating P-type ATPase  55.88 
 
 		 796 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3508  secretion protein HlyD  70.37 
 
 		 460 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.94 
 
 		 406 aa  49.7  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  62.86 
 
 		 500 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  36.76 
 
 		 715 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 795 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  59.46 
 
 		 472 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  60 
 
 		 513 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2604  heavy metal translocating P-type ATPase  75 
 
 		 735 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.335287 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  62.86 
 
 		 502 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  66.67 
 
 		 526 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.692441 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>