86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1410 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1266    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  34.36 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  29.68 
 
 		 691 aa  137  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  33.02 
 
 		 291 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  30.23 
 
 		 534 aa  120  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  28.79 
 
 		 769 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  30.28 
 
 		 770 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  30.28 
 
 		 770 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  29.92 
 
 		 530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  28.48 
 
 		 769 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  29.97 
 
 		 770 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  29.1 
 
 		 770 aa  114  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  30.28 
 
 		 770 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  27.24 
 
 		 770 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  24.39 
 
 		 449 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  30.08 
 
 		 772 aa  100  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  25.08 
 
 		 768 aa  97.4  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  26.76 
 
 		 769 aa  96.3  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  33.91 
 
 		 274 aa  89  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  31.5 
 
 		 454 aa  87.4  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  34.95 
 
 		 197 aa  86.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  25.56 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  42.11 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  26.22 
 
 		 759 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  28.76 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  25.25 
 
 		 838 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  28.18 
 
 		 327 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  25.3 
 
 		 838 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  31.29 
 
 		 440 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  28.46 
 
 		 755 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  25.36 
 
 		 746 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  25.84 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  25.9 
 
 		 757 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  24.75 
 
 		 838 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  25.06 
 
 		 836 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  27.38 
 
 		 755 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  27.07 
 
 		 720 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  32.11 
 
 		 230 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  29.46 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  27.22 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  29.53 
 
 		 614 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  29.41 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0942  hypothetical protein  30 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  26.19 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  24.38 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  24.38 
 
 		 722 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  24.23 
 
 		 722 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  24.17 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  28.7 
 
 		 175 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  27.78 
 
 		 175 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  30.17 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  27.99 
 
 		 720 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  28.89 
 
 		 566 aa  57  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  29.46 
 
 		 159 aa  56.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  26.67 
 
 		 134 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  24.09 
 
 		 354 aa  56.2  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  21.38 
 
 		 590 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0968  hypothetical protein  33.06 
 
 		 545 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.7656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  23.74 
 
 		 580 aa  52.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  22.44 
 
 		 602 aa  51.6  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2239  hypothetical protein  34.31 
 
 		 154 aa  50.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.638475  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0281  hypothetical protein  37.78 
 
 		 179 aa  50.4  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  26.62 
 
 		 180 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  26.09 
 
 		 571 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4388  hypothetical protein  32.98 
 
 		 108 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748198  normal  0.178906 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  31.36 
 
 		 580 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  25 
 
 		 577 aa  48.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1752  glycosyl hydrolase  25.46 
 
 		 1514 aa  48.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  22.9 
 
 		 576 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  25.87 
 
 		 566 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  22.99 
 
 		 576 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  27.12 
 
 		 203 aa  47  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  30.25 
 
 		 566 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3367  hypothetical protein  35.14 
 
 		 152 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379877  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  27.78 
 
 		 566 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  30.33 
 
 		 240 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1250  hypothetical protein  40.3 
 
 		 115 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0116  hypothetical protein  22.22 
 
 		 351 aa  45.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  24.91 
 
 		 576 aa  44.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  30.83 
 
 		 566 aa  44.3  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4089  MORN variant repeat protein  28.7 
 
 		 191 aa  44.3  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  27.59 
 
 		 566 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2294  hypothetical protein  46.81 
 
 		 143 aa  43.9  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0453403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>