18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0281 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0281  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641005  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  37.78 
 
 
621 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  38.67 
 
 
449 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  30.77 
 
 
691 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  32.94 
 
 
770 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  32.94 
 
 
770 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  36.71 
 
 
291 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  28.1 
 
 
769 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  26 
 
 
534 aa  44.7  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  28.1 
 
 
770 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  29.41 
 
 
770 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  30.21 
 
 
769 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  32.89 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  29.41 
 
 
770 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  30.21 
 
 
770 aa  42.4  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  31.76 
 
 
772 aa  42  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  29.06 
 
 
203 aa  41.6  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  25 
 
 
134 aa  41.6  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>