178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0340 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0340  carbon-nitrogen family hydrolase  100 
 
 
241 aa  496  1e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3062  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.25 
 
 
245 aa  221  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.108862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.81 
 
 
241 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3933  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.42 
 
 
241 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0517801 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5643  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.64 
 
 
249 aa  175  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.95 
 
 
250 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.097808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.86 
 
 
245 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0688  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.26 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2562  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  37.5 
 
 
285 aa  136  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.98 
 
 
287 aa  132  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0160508  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.17 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0568689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1348  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
312 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000484871 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
312 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.19 
 
 
193 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.321616  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.62 
 
 
322 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.16 
 
 
311 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
302 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.664422  normal  0.835377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.81 
 
 
310 aa  95.9  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
314 aa  95.5  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0183  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
317 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.728096  normal  0.187827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.25 
 
 
311 aa  92.4  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
320 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.182495  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5134  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.451686  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2527  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.46 
 
 
303 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0398  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
311 aa  72  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.5698  normal  0.0792135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205893  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4059  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
316 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129791  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.77 
 
 
358 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1372  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.95 
 
 
376 aa  52.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5601  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 
746 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.47 
 
 
355 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
334 aa  52  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0687  dihydroflavonol 4-reductase, putative  31.03 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0174586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2821  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0273473  normal  0.296393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.31 
 
 
342 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1185  steroid dehydrogenase  26.92 
 
 
351 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.809029 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00019  carnitine acetyl transferase (AFU_orthologue; AFUA_2G12530)  27.08 
 
 
417 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1368  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  25.79 
 
 
349 aa  48.9  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
338 aa  48.5  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  30 
 
 
333 aa  48.5  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2147  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
342 aa  48.5  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.538907  hitchhiker  0.000599316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.700387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
342 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
303 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00630  hypothetical protein  29.24 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.86 
 
 
342 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
313 aa  47  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 
352 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.66 
 
 
298 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
316 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0935797  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  28.08 
 
 
334 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
335 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1008  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  27.07 
 
 
338 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.720845  normal  0.076451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.83 
 
 
312 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
358 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
335 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
335 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
335 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.68 
 
 
297 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28888  predicted protein  27.17 
 
 
321 aa  46.6  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.760508  normal  0.324549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  27.27 
 
 
328 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  28.57 
 
 
335 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3398  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  24.2 
 
 
307 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3376  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  24.22 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  28.47 
 
 
337 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3402  NAD dependent epimerase/dehydratase family superfamily  24.2 
 
 
307 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.36 
 
 
355 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.461337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0224  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 
327 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2234  hopanoid-associated sugar epimerase  28.57 
 
 
329 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 
302 aa  45.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148283  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3266  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
321 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0884  hopanoid-associated sugar epimerase  26.06 
 
 
329 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000222195 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2297  GDP-D-mannose dehydratase, putative  22.79 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 
338 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.214439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3293  WcbK  22.79 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402008  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0531  putative GDP-D-mannose dehydratase  22.79 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1069  putative GDP-D-mannose dehydratase  22.79 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  29.81 
 
 
339 aa  44.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.09 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.552356  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3279  GDP-6-deoxy-D-lyxo-4-hexulose reductase  22.79 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.409914  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2175  putative GDP-D-mannose dehydratase  22.79 
 
 
337 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.02 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.93 
 
 
338 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  27.73 
 
 
335 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  26.43 
 
 
329 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  28.06 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1420  hypothetical protein  27.01 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.23 
 
 
331 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3779  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase protein  26.72 
 
 
353 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.38 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.114854 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  27.73 
 
 
335 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.68 
 
 
296 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>