More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0201 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0201  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 subunit  100 
 
 
140 aa  292  8e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2032  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 subunit  52.94 
 
 
140 aa  153  7e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  45.99 
 
 
745 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.48 
 
 
676 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  47.95 
 
 
713 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1544  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  45.59 
 
 
374 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.48 
 
 
676 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.76 
 
 
676 aa  137  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.63 
 
 
716 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.76 
 
 
688 aa  135  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.2 
 
 
879 aa  135  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.2 
 
 
677 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.6 
 
 
688 aa  134  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1029  NADH dehydrogenase I chain G  46.32 
 
 
358 aa  134  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.63 
 
 
716 aa  133  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.91 
 
 
674 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.18 
 
 
674 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  50 
 
 
716 aa  133  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.97 
 
 
685 aa  133  8e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.6 
 
 
688 aa  133  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1831  NADH dehydrogenase I chain G  47.06 
 
 
363 aa  133  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.18 
 
 
674 aa  133  9e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.06 
 
 
893 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0785  NADH dehydrogenase I chain G  48.57 
 
 
353 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.76 
 
 
686 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.6 
 
 
688 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.45 
 
 
674 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  46.58 
 
 
715 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  46.58 
 
 
715 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.52 
 
 
1440 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.85 
 
 
904 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  46.58 
 
 
715 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.58 
 
 
715 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.58 
 
 
715 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  46.58 
 
 
715 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.45 
 
 
893 aa  130  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.93 
 
 
893 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0472  formate dehydrogenase-like protein  44.6 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1796  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.45 
 
 
135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.461798  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0282  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  45.89 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.38 
 
 
886 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.55 
 
 
686 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.58 
 
 
716 aa  127  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.55 
 
 
1440 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.21 
 
 
718 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.2 
 
 
900 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.21 
 
 
723 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  45.14 
 
 
716 aa  125  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.45 
 
 
917 aa  126  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.17 
 
 
687 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  46.32 
 
 
359 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  43.17 
 
 
689 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  45.21 
 
 
715 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0845  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  45.83 
 
 
376 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.21 
 
 
715 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.99 
 
 
808 aa  125  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  45.21 
 
 
715 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.34 
 
 
1426 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2946  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  46.76 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.750797  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.6 
 
 
905 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  46.04 
 
 
695 aa  124  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  43.17 
 
 
687 aa  123  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  43.36 
 
 
1412 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.26 
 
 
900 aa  121  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  40.29 
 
 
899 aa  121  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.13 
 
 
1410 aa  120  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  47.1 
 
 
737 aa  120  8e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.34 
 
 
1428 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  42.55 
 
 
1387 aa  118  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.97 
 
 
886 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.97 
 
 
886 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.45 
 
 
901 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.86 
 
 
986 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.97 
 
 
906 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0923  molybdopterin oxidoreductase  42.03 
 
 
621 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000228459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.33 
 
 
929 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.15 
 
 
1406 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.72 
 
 
685 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.43 
 
 
1424 aa  115  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  41.84 
 
 
1385 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1856  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.01 
 
 
351 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.82 
 
 
963 aa  113  8.999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 
960 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.69 
 
 
933 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.07 
 
 
687 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 
960 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.29 
 
 
959 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.45 
 
 
689 aa  111  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.59 
 
 
1421 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.52 
 
 
994 aa  110  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.29 
 
 
960 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2705  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  42.96 
 
 
355 aa  110  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.41 
 
 
984 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.84 
 
 
945 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.41 
 
 
984 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.42 
 
 
983 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.42 
 
 
983 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.42 
 
 
983 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.13 
 
 
1432 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.42 
 
 
983 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>