More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1252 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1252  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0945  ABC transporter related  56.83 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1048  ABC transporter related  55.95 
 
 		 233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0450  ABC transporter related  41.44 
 
 		 234 aa  174  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.68217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0805  ABC transporter related  39.74 
 
 		 239 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  43.11 
 
 		 238 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2003  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.64 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  47.47 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1520  ABC transporter related  38.74 
 
 		 234 aa  168  8e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00000116911  normal  0.55124 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1181  ABC transporter related  42.15 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0329  ABC transporter related  37.22 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.287188  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0545  ABC transporter related  40.54 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.699298  hitchhiker  0.000807716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  40.44 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5755  ABC transporter related  41.56 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.805145  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2274  ABC transporter related  42.29 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.631731  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  42.08 
 
 		 235 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2953  ABC transporter related  42.73 
 
 		 249 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.181983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2971  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.202994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1161  ABC transporter related  40.61 
 
 		 240 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1795  ABC transporter related  40.61 
 
 		 240 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  39.91 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  38.33 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  37.44 
 
 		 238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2990  ABC transporter ATP-binding protein  44.6 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  37 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0296  ABC transporter related  41.3 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.280952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3377  ABC transporter related  43.46 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  37 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  37.44 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  37.44 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  41.33 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  43.35 
 
 		 852 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  41.03 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  36.56 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  37.45 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  40.26 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1710  ABC transporter related  38.94 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  45.12 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  41.63 
 
 		 233 aa  161  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0704  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.78 
 
 		 230 aa  161  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000400614 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5330  ABC transporter related  42.98 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.240884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 234 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 		 238 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7910  ABC transporter related  41.48 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4448  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  43.87 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  0.174311 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4906  ABC transporter related  40.27 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.463566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  40.43 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  36.56 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  39.92 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  43.42 
 
 		 840 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3318  ABC transporter related  45.28 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  43.42 
 
 		 840 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  39.64 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  38.94 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5672  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.89 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0803  ABC transporter related  40.17 
 
 		 252 aa  159  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1819  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.527395  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  41.18 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3912  ABC transporter related  40.09 
 
 		 240 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.478382  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  41.18 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  42.61 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  41.81 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  37.44 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  40.27 
 
 		 838 aa  159  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.92 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3736  ABC transporter related  40.89 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4632  ABC transporter related  40.89 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.267394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0149  ABC transporter related  44.13 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.744689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  39.11 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  42.4 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2130  ABC transporter related  42.04 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.18 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  43.24 
 
 		 842 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.47 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  40.91 
 
 		 231 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3803  ABC transporter related  40.97 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373546  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  39.65 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0658  putative branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.72 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.350173 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1679  ABC transporter-like protein  41.7 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.2537  normal  0.0768267 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1307  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.91 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175129  normal  0.829874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1670  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.69 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.161452  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  41.89 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0701  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4074  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.07 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1088  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  41.26 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2256  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  42.86 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  41.85 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0192  ABC transporter related  40.54 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0434  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.66 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.03996  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>