More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0203 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0203  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7131  IclR family transcriptional regulator  70.63 
 
 		 280 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0713  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0194  transcriptional regulator, IclR family  33.74 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0903072  decreased coverage  0.000072825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1941  IclR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383079  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0978  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 292 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0639197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  27.63 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  29.77 
 
 		 279 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4394  IclR family transcriptional regulator family  32.62 
 
 		 336 aa  97.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 277 aa  92.8  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 325 aa  92.4  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  27.41 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  27.41 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.41 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.41 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.41 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  27.41 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 257 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.56 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.56 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 274 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.74 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.67 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  25.3 
 
 		 262 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29 
 
 		 276 aa  89.7  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  28.47 
 
 		 274 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 272 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 255 aa  89  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 257 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  25.62 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 260 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  26.32 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  25.51 
 
 		 246 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 		 249 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0624  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.31 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.10241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0563  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.31 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0570  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.31 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0565  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.31 
 
 		 272 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  26.56 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  27.49 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  28.05 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  25 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  26.75 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  28.32 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  24.5 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  25.86 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.75 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  27.4 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  25.6 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  27.38 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  24.1 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  23.9 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.15 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  26.15 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  26.15 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  26.15 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  26.15 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  29.55 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  26.15 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  26.15 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  26.64 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  25.4 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  25.4 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  26.94 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  25.21 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3701  transcriptional regulator, IclR family  24.77 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  26.75 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>