More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2397 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2397  putative heat shock Hsp20-related protein  100 
 
 
135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0523871  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6092  heat shock protein Hsp20  65.91 
 
 
135 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2601  Hsp20 family heat-shock protein  64.39 
 
 
135 aa  180  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188281  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6389  heat shock protein Hsp20  64.39 
 
 
135 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0663133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5261  heat shock protein Hsp20  62.22 
 
 
135 aa  177  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.071325 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6253  heat shock protein Hsp20  58.7 
 
 
141 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6420  heat shock protein Hsp20  58.7 
 
 
146 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6655  heat shock protein Hsp20  58.7 
 
 
146 aa  167  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381902  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  58.99 
 
 
139 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3431  heat shock protein Hsp20  58.99 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349992  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2810  HSP20 family protein  64 
 
 
131 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175635  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2613  Hsp20 family heat-shock protein  60.71 
 
 
142 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000019665  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4540  Hsp20 family heat-shock protein  60.71 
 
 
142 aa  160  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112582  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4649  heat shock protein Hsp20  57.66 
 
 
137 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.54341  normal  0.729236 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1246  HSP20 family protein  62.4 
 
 
133 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0529  HSP20 family protein  62.4 
 
 
133 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1440  HSP20 family protein  62.4 
 
 
133 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0625  HSP20 family protein  62.4 
 
 
133 aa  159  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5151  heat shock protein Hsp20  55.22 
 
 
135 aa  159  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1571  putative heat shock protein  62.4 
 
 
133 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1471  HSP20 family protein  62.4 
 
 
133 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3388  HSP20 family protein  58.27 
 
 
139 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0799527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3423  HSP20 family protein  58.27 
 
 
139 aa  157  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2614  HSP20 family protein  57.55 
 
 
139 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484892  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2427  HSP20 family protein  57.55 
 
 
139 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3427  HSP20 family protein  57.55 
 
 
139 aa  156  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000520104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1203  HSP20 family protein  57.55 
 
 
139 aa  156  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0342  HSP20 family protein  57.55 
 
 
162 aa  156  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187953  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2579  putative low molecular weight heat shock protein, Hsp20-related  54.01 
 
 
137 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2043  putative heat shock protein  53.1 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778686  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2056  heat shock protein Hsp20  57.78 
 
 
137 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4405  heat shock protein Hsp20  55.56 
 
 
136 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1153  heat shock protein Hsp20  62.62 
 
 
138 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.405022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1141  heat shock protein Hsp20  60.36 
 
 
139 aa  116  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0781  heat shock protein Hsp20  51.11 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1262  heat shock protein Hsp20  51.11 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142057  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1731  HSP20 family protein  49.06 
 
 
126 aa  110  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.13098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1234  heat shock protein Hsp20  58.1 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308291  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1324  heat shock protein Hsp20  48.7 
 
 
195 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1973  heat shock protein Hsp20  44.88 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.287455  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3376  heat shock protein Hsp20  43.7 
 
 
130 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  43.97 
 
 
135 aa  93.6  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1174  heat shock protein Hsp20  43.64 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3313  heat shock protein, putative  40.16 
 
 
123 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.257763  normal  0.279554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5732  hypothetical protein  68.85 
 
 
114 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34005  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  40 
 
 
132 aa  87.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2642  heat shock protein Hsp20  41.53 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3255  heat shock protein Hsp20  42.31 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2959  heat shock protein Hsp20  40.19 
 
 
143 aa  84  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167076 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3666  heat shock protein Hsp20  37.01 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0358  Hsp20-like molecular chaperone  36.64 
 
 
134 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3774  heat shock protein Hsp20  36.22 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2522  heat shock protein Hsp20  35.65 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0183  heat shock protein Hsp20  35.43 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0939501  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  33.86 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4462  heat shock protein Hsp20  35.4 
 
 
132 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0390  heat shock protein Hsp20  36.45 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.833766  normal  0.703561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0792  heat shock protein Hsp20  36.36 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2409  HSP20 family protein  34.11 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3461  heat shock protein Hsp20  32.71 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798121  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0720  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
120 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00436062  normal  0.512737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  34.58 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  38.68 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7807  Hsp20 family heat-shock protein  30.33 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00129467  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  31.11 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1344  HSP20 family protein  35.29 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.624294  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6439  heat shock protein Hsp20  36.28 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.024706  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4499  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.100268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  31.73 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4352  heat shock protein Hsp20  35.09 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.735936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  31.85 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4488  heat shock protein Hsp20  34.21 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5151  heat shock protein Hsp20  34.55 
 
 
148 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0184623  normal  0.32984 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2986  heat shock protein Hsp20  32.38 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130326  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  36.79 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3091  HSP20 family protein  31.73 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4507  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3078  heat shock protein Hsp20  33.33 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700712  normal  0.0754711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2635  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000662159  normal  0.965311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3386  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1127  heat shock protein Hsp20  34.29 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  32.46 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1474  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.242626  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1537  heat shock protein Hsp20  35.83 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4766  heat shock protein Hsp20  32.08 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000408851  hitchhiker  0.00874264 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0735  heat shock protein Hsp20  32.41 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000037192  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0200  heat shock protein Hsp20  37.27 
 
 
176 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.377048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0936  heat shock protein Hsp20  34.82 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.172536  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  34.91 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0623  heat shock protein Hsp20  31.13 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.844177  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  37.08 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  30.19 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1167  heat shock protein Hsp20  32.17 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3219  heat shock protein  30.19 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3093  heat shock protein  30.19 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  30.19 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>