More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1421 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  40.18 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  38.53 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  38.97 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  35 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 226 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 222 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 226 aa  124  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  33 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 257 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 213 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 229 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 251 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 231 aa  98.6  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2320  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  29.95 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.62 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2831  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 240 aa  95.5  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 233 aa  95.5  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>