More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2756 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  100 
 
 
234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  53.42 
 
 
235 aa  254  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  50.21 
 
 
234 aa  247  9e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  52.99 
 
 
234 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0356  ABC transporter related  53.42 
 
 
242 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  50.85 
 
 
233 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  50 
 
 
233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  53.22 
 
 
237 aa  242  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  54.74 
 
 
237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  50.64 
 
 
234 aa  241  5e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
237 aa  240  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  52.99 
 
 
238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
235 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  50 
 
 
236 aa  238  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  52.56 
 
 
238 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  51.93 
 
 
234 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  52.56 
 
 
238 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  48.93 
 
 
235 aa  236  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  52.56 
 
 
238 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  48.29 
 
 
236 aa  235  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
234 aa  235  6e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  50.21 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  51.93 
 
 
236 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  54.94 
 
 
240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  48.93 
 
 
233 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  51.48 
 
 
246 aa  231  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0429  ABC transporter related protein  52.99 
 
 
236 aa  231  8.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0665376  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5692  ABC transporter related  51.5 
 
 
234 aa  231  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  50.64 
 
 
237 aa  230  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3251  ABC transporter related  49.36 
 
 
244 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.409865  normal  0.293601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  50.64 
 
 
238 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  49.79 
 
 
236 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4863  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  51.07 
 
 
238 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000477464  hitchhiker  0.0000052401 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4741  ABC transporter related  51.07 
 
 
238 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000344378  hitchhiker  0.000000131699 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  49.57 
 
 
235 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  51.71 
 
 
239 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1519  ABC transporter related  51.5 
 
 
264 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.469859  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1863  ABC transporter related  51.28 
 
 
238 aa  228  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  51.07 
 
 
246 aa  228  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  50.64 
 
 
236 aa  228  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0402  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  48.5 
 
 
236 aa  228  7e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4710  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
236 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  48.5 
 
 
239 aa  227  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0556  ABC transporter-like  50.64 
 
 
238 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000214193  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2365  ABC transporter related  52.14 
 
 
235 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5119  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6017  ABC transporter related  50.64 
 
 
251 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.896257  hitchhiker  0.00867061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0731  ABC transporter related  51.07 
 
 
236 aa  226  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.346803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4919  ABC transporter related  50.64 
 
 
238 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000800081  decreased coverage  0.0000000000000903598 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1127  ABC transporter related  48.5 
 
 
235 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2495  ABC transporter related  51.69 
 
 
238 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427915  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2236  ABC transporter related  47.21 
 
 
234 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0732075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0601  ABC transporter  49.79 
 
 
238 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.190896  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.93 
 
 
235 aa  226  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1578  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 
236 aa  225  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3199  ABC transporter-related protein  50.64 
 
 
234 aa  225  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  51.06 
 
 
243 aa  225  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  50 
 
 
237 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  48.54 
 
 
247 aa  225  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  50.85 
 
 
239 aa  224  7e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
245 aa  224  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2264  ABC transporter related  48.93 
 
 
234 aa  224  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0714908  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0288  ABC transporter related  50.43 
 
 
241 aa  224  9e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  48.07 
 
 
236 aa  224  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4937  ABC transporter related  47.01 
 
 
257 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  47.21 
 
 
237 aa  223  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  49.79 
 
 
238 aa  222  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1584  ABC transporter related  45.06 
 
 
234 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6584  ABC transporter related  49.79 
 
 
245 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.633643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  49.36 
 
 
235 aa  222  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4915  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 
238 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0639  ABC transporter related protein  48.5 
 
 
234 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.384075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  47.01 
 
 
259 aa  221  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4055  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.07 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  48.5 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0899  ABC transporter related  46.98 
 
 
238 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2498  ABC transporter related  49.36 
 
 
234 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  51.07 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  49.36 
 
 
234 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0274  ABC transporter related  47.44 
 
 
234 aa  219  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655874  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  47.9 
 
 
247 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  47.9 
 
 
247 aa  219  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  50.21 
 
 
247 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1698  ABC transporter related  50.43 
 
 
242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0731  ABC transporter related  48.93 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  45.3 
 
 
238 aa  218  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
236 aa  218  5e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64860  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
238 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000027849  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.3 
 
 
238 aa  218  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  47.28 
 
 
247 aa  217  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0108  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  51.07 
 
 
233 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  45.11 
 
 
258 aa  217  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 
235 aa  216  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  47.21 
 
 
234 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0355  ABC transporter related  50.43 
 
 
234 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  49.14 
 
 
240 aa  216  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  48.07 
 
 
233 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1617  ABC transporter related  45.06 
 
 
234 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  49.36 
 
 
234 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
238 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>