146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4784 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4784  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0719  transport protein  62.57 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.32232 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001064  vibrioferrin membrane-spanning transport protein PvsC  38.98 
 
 		 401 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09320  transporter, MFS superfamily  45.9 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00863516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3093  transport protein  41.16 
 
 		 381 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.935055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01929  transport protein  42.82 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3138  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1277  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  23.92 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.75 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  28.92 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  28.87 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  24.03 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  28.04 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  24.8 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  26.72 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  26.72 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  26.72 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  25.57 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  25.57 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  25.57 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  25.57 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  25.32 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  26.47 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  26.47 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  25.51 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  35.14 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0180  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  35.14 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0636  hypothetical protein  37.35 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  44.12 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  24.87 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 410 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  33.66 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 404 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4078  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 417 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  31.63 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  31.63 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  31.63 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  33 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  31.63 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  31.63 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  31.63 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  31.63 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  31.63 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  31.63 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  39.39 
 
 		 411 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0813  class H tetracycline resistance efflux protein  28.05 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0075  major facilitator transporter  28 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.884221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  25.27 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  36.36 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  20.56 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  35 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  29.81 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 396 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  32.61 
 
 		 413 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4394  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 538 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.497016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  36.36 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  36.36 
 
 		 411 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>