More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3827 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  94.46 
 
 		 349 aa  578  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  77.85 
 
 		 330 aa  501  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  66 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  66 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  61.95 
 
 		 331 aa  408  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  63.02 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  64.67 
 
 		 326 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  63.73 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  57.53 
 
 		 328 aa  346  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  52.52 
 
 		 328 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  57.43 
 
 		 335 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  51.33 
 
 		 327 aa  299  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.43 
 
 		 331 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.33 
 
 		 326 aa  265  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  43.85 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 		 335 aa  262  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  43.56 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1676  hypothetical protein  44.48 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.82 
 
 		 339 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.01 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  42.15 
 
 		 322 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  42.19 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  41.91 
 
 		 322 aa  255  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  43.33 
 
 		 340 aa  255  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.48 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.08 
 
 		 327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.78 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.61 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.55 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  42.06 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.67 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.55 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  45.83 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  40.8 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  44.2 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.24 
 
 		 336 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.76 
 
 		 325 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  42.76 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  44.78 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  44.78 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  40.8 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.58 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.05 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.56 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.33 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.5 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  46.69 
 
 		 321 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  45.52 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  42.23 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.62 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.18 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  40.8 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.88 
 
 		 335 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.39 
 
 		 331 aa  248  7e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.38 
 
 		 324 aa  248  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  43 
 
 		 334 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3785  hypothetical protein  42.03 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141562  normal  0.251227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.39 
 
 		 331 aa  248  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.78 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  43.65 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  42.9 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.44 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.48 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.97 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  43.48 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  48.03 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.13 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.25 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  45.82 
 
 		 341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  42.96 
 
 		 321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  41.14 
 
 		 326 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  43.52 
 
 		 339 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  43.15 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  40.31 
 
 		 330 aa  245  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.05 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  40.12 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  37.76 
 
 		 329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  42.23 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.8 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  44.03 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.33 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  42.16 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.82 
 
 		 345 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.62 
 
 		 324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  41.46 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  40.12 
 
 		 329 aa  242  5e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.82 
 
 		 345 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.72 
 
 		 318 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  41.29 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  39.8 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  41.89 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.96 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  41.88 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  41.67 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  36.06 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>