More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0198 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 328 aa  663    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  89.33 
 
 		 355 aa  607  1e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  62.61 
 
 		 329 aa  435  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  61.33 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  51.02 
 
 		 328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  49.85 
 
 		 330 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  49.7 
 
 		 331 aa  297  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  50.16 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  50.83 
 
 		 331 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  48.18 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  50 
 
 		 329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  42.68 
 
 		 338 aa  269  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  40.58 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  38.61 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  37.22 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  36.89 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  36.47 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.66 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  36.59 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  37.41 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.47 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  35.84 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.07 
 
 		 325 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3575  hypothetical protein  35.74 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.571272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  35.74 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  36.18 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2145  hypothetical protein  36.61 
 
 		 330 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.467573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1798  hypothetical protein  35.15 
 
 		 329 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  34.64 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  36.05 
 
 		 333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  35.49 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  37.2 
 
 		 341 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  36.83 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  37.59 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  34.47 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.72 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  32.32 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.54 
 
 		 327 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.42 
 
 		 333 aa  178  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  36.34 
 
 		 331 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  35.03 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.15 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33.79 
 
 		 322 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  34.38 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  35.08 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  36.08 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  37.18 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.17 
 
 		 349 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  36.82 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  35.4 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  34.26 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  31.93 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  33.94 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0792  hypothetical protein  37.41 
 
 		 326 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  34.36 
 
 		 322 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  34.14 
 
 		 353 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  34.93 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  34.01 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  32.82 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  33.93 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2823  hypothetical protein  36.95 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628668  normal  0.0754293 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  35.54 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  36.33 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  33.64 
 
 		 336 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  36.62 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  33.53 
 
 		 331 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  34.27 
 
 		 331 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  32.83 
 
 		 331 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  34.35 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  34.97 
 
 		 327 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  34.36 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  32.54 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  32.21 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  34.42 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  36.68 
 
 		 322 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  35.89 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  34.95 
 
 		 327 aa  169  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6081  hypothetical protein  35.26 
 
 		 326 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  34.48 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  32.72 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  35.93 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  34.35 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  33.74 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  34.97 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  33.45 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  34.54 
 
 		 324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  34.12 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  34.15 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  34.14 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  32.01 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  34.01 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  31.79 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  32.8 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  31.58 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  35.09 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  31.91 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  33.79 
 
 		 337 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>