More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4649 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4649  GntR domain protein  100 
 
 		 218 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2541  transcriptional regulator  39 
 
 		 226 aa  134  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  36.67 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  38.21 
 
 		 243 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  35.05 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2629  GntR domain protein  33.49 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5994  GntR-like protein  32.23 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1232  GntR-like  33.02 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6600  GntR domain-containing protein  33.02 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  normal  0.274665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1565  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4165  GntR domain-containing protein  35.65 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218155  normal  0.105526 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  32.72 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2539  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.824223  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  36.95 
 
 		 230 aa  98.6  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1711  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00570567  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0365  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  35.1 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  33.66 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 265 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.58 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4270  hypothetical protein  32.41 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  33.33 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  28.12 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  30.94 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.02 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.02 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.02 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  34.42 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  30.48 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  29.44 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.8 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  34.72 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.93 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  27.88 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.06 
 
 		 258 aa  78.2  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.41 
 
 		 258 aa  78.2  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  29.59 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  31.43 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4185  GntR domain-containing protein  34.91 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440271 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.06 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  32.2 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  32.86 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.41 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  29.35 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  29.35 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  29.35 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  29.35 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.7 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  33.64 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.56 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  29.35 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.36 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0011  GntR domain protein  35.05 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.4 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.18 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  29.33 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  29.36 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  30.49 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  29 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.43 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  31.55 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  29 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  29 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  30.43 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.43 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  30.43 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  30.43 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.43 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.43 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  31.53 
 
 		 242 aa  74.7  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  28 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28.38 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  30.53 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  31.11 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  34.63 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  31.34 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  31.63 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  28 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.77 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>