More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4278 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  100 
 
 		 313 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  93.93 
 
 		 312 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  83.55 
 
 		 316 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  80.58 
 
 		 313 aa  517  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  80.58 
 
 		 313 aa  517  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  80.58 
 
 		 316 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  80.58 
 
 		 313 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  80.58 
 
 		 313 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  71.01 
 
 		 315 aa  442  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  69.93 
 
 		 322 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  68.08 
 
 		 312 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  66.12 
 
 		 316 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  61.66 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  60.58 
 
 		 350 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  60.9 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  60.7 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  57.52 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  57.69 
 
 		 353 aa  358  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  55.52 
 
 		 366 aa  352  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  53.03 
 
 		 368 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  55.21 
 
 		 372 aa  348  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  54.89 
 
 		 363 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  51.67 
 
 		 362 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  57.43 
 
 		 303 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  57.48 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  56.62 
 
 		 304 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  55.88 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  55.3 
 
 		 304 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  53.92 
 
 		 303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  53.97 
 
 		 306 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  52.96 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  53.2 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  53.38 
 
 		 299 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  77.72 
 
 		 183 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  77.72 
 
 		 183 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  51.99 
 
 		 296 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  50.98 
 
 		 308 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  49.51 
 
 		 304 aa  291  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  51.83 
 
 		 307 aa  289  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  51.83 
 
 		 302 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  48.21 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  50 
 
 		 307 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  53.19 
 
 		 302 aa  275  7e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  47.02 
 
 		 304 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  46.96 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  47.54 
 
 		 415 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  44.72 
 
 		 371 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  43.77 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3342  Gluconolactonase  43.63 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  45.39 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  47.24 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.58 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  46.69 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  42.47 
 
 		 286 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1491  Gluconolactonase  42.19 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0043  gluconolactonase  83.74 
 
 		 131 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.420419  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1471  gluconolactonase precursor  83.74 
 
 		 131 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  43.64 
 
 		 281 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3888  Gluconolactonase  41.05 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  44.33 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6221  gluconolactonase  42.37 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.162368  normal  0.0196248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3691  Gluconolactonase  40.07 
 
 		 281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.988188  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0231  Gluconolactonase  37.85 
 
 		 325 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381045 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0766  gluconolactonase  37.92 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0732878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2426  Gluconolactonase  37.92 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.151955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0764  gluconolactonase  37.1 
 
 		 338 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0355462  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0573  gluconolactonase  33.86 
 
 		 338 aa  182  9.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0622  gluconolactonase  33.23 
 
 		 338 aa  178  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.347955  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1345  gluconolactonase  34.87 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4181  gluconolactonase  37.5 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.878915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  37.8 
 
 		 533 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3203  Gluconolactonase  36.84 
 
 		 342 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  0.0664267 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3928  Gluconolactonase  35.06 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.617042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5570  Gluconolactonase  38.03 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2519  Gluconolactonase  33.99 
 
 		 545 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0256346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  59.54 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03689  gluconolactonase  40.16 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3561  gluconolactonase  30.99 
 
 		 340 aa  142  9e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.276936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4750  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.14 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.143431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.01 
 
 		 334 aa  133  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08977  AkePPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARV3]  31.52 
 
 		 353 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000540741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2728  gluconolactonase  31.68 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.698337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6025  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.64 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0625  gluconolactonase  31.35 
 
 		 340 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.41477 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0076  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.62 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2641  gluconolactonase  26.55 
 
 		 398 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.86 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.86 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2162  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.75 
 
 		 581 aa  93.2  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.021246  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.19 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.96 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.57 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.57 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.19 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01840  lactonohydrolase, putative  33.33 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4476  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.44 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0784664  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05363  hypothetical protein  30.08 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00449707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4613  gluconolactonase  27.03 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3108  gluconolactonase  31.2 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3453  gluconolactonase  28.52 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>