More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2730 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2730  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 203 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6957  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.87 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0201  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.58 
 
 		 217 aa  223  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  45.45 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  44.44 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  42 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  42.42 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  42.42 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  42 
 
 		 202 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  41.92 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.42 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3458  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.24 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  41.21 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.93 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  41.21 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  41.21 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.33 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194299 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1295  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  45.18 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  41.21 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3062  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.09 
 
 		 203 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58769  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  40.2 
 
 		 201 aa  171  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  42.71 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  43.28 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  42.71 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  40.2 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  40.4 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.78 
 
 		 195 aa  168  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 215 aa  167  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1548  isopropylmalate isomerase small subunit  45.03 
 
 		 204 aa  167  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.165609  normal  0.0663452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  42.11 
 
 		 216 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  41.92 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.06 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  41.9 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  43.2 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  39.2 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.26 
 
 		 216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  41.71 
 
 		 216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  41.71 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  39.7 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  39.7 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24772  predicted protein  40.87 
 
 		 801 aa  164  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1960  isopropylmalate isomerase small subunit  43.3 
 
 		 204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  41.23 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  40.7 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  41.26 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  39.7 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  42.58 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  39.2 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.63 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.42 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09800  3-isopropylmalate dehydratase small subunit LeuD2  42.86 
 
 		 202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  46.24 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2939  isopropylmalate isomerase small subunit  46.24 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3408  isopropylmalate isomerase small subunit  45.7 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  42.03 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.06 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  41.06 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1984  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.39 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.440019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  41.06 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.26 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  41.75 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  41.55 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  40.2 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  41.5 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  41.21 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  41.26 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  41.15 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  41.26 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  41.15 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  41.15 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  43.75 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.78 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  41.15 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  41.55 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  42.11 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  42.41 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  41.15 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  41.15 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0776  isopropylmalate isomerase small subunit  45.03 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  41.15 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0626  isopropylmalate isomerase small subunit  45.03 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  41.15 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.8 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  41.24 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  41.55 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3271  isopropylmalate isomerase small subunit  47.03 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  38.83 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  41.9 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.87 
 
 		 215 aa  158  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  40.58 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  38.89 
 
 		 722 aa  158  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  38.69 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  40.58 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  40.58 
 
 		 216 aa  158  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.87 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  41.26 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>