More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1295 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1295  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09800  3-isopropylmalate dehydratase small subunit LeuD2  62.5 
 
 		 202 aa  263  8.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0364  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  60.7 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0371  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  60.2 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0422  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  60.2 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0362  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  60.2 
 
 		 208 aa  248  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.9 
 
 		 202 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3062  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53 
 
 		 203 aa  214  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58769  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3458  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.27 
 
 		 205 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  48 
 
 		 201 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  47.5 
 
 		 201 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0201  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.5 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  47.5 
 
 		 211 aa  193  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  47 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  47.5 
 
 		 201 aa  192  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46 
 
 		 201 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  46 
 
 		 209 aa  191  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  46 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  46.31 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  45.5 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  45.5 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  46.57 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 201 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  44 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6957  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.84 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  44 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  46.5 
 
 		 201 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  45.5 
 
 		 201 aa  184  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  46 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.5 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  47 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.38 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  45.5 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  45.5 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  45.5 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.54 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  43.5 
 
 		 201 aa  177  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.83 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  45 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  43.06 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  42.58 
 
 		 216 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  43.5 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.5 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  42.71 
 
 		 194 aa  175  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  45.32 
 
 		 762 aa  174  8e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001659  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  41.67 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.02 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  45 
 
 		 722 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  42.58 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2730  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  44.66 
 
 		 772 aa  172  3.9999999999999995e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  41.63 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  42.58 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00814  isopropylmalate isomerase small subunit  41.67 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  40.67 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  41.43 
 
 		 217 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  41.4 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  41.4 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  43 
 
 		 200 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  42.11 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  41.15 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.54 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  42.58 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.38 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24772  predicted protein  44.29 
 
 		 801 aa  169  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  40.19 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  40.1 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  40.19 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  42.58 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  40.67 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  40.19 
 
 		 216 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  40.67 
 
 		 216 aa  168  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  40.19 
 
 		 216 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  42.11 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  40.62 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1562  isopropylmalate isomerase small subunit  43.16 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  42.11 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  39.71 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  39.71 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  39.71 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  39.71 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3888  isopropylmalate isomerase small subunit  42.71 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  41.75 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  39.72 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  39.71 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  39.71 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  39.71 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1288  isopropylmalate isomerase small subunit  42.71 
 
 		 193 aa  167  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1456  isopropylmalate isomerase small subunit  42.71 
 
 		 193 aa  167  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  41.15 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1523  isopropylmalate isomerase small subunit  42.63 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  41.63 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1494  isopropylmalate isomerase small subunit  42.63 
 
 		 193 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  41.63 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>