More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0371 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0371  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0364  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  99.52 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0422  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0362  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  99.52 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1295  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  60.2 
 
 		 204 aa  260  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2359  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.71 
 
 		 202 aa  242  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09800  3-isopropylmalate dehydratase small subunit LeuD2  57.71 
 
 		 202 aa  236  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3062  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.76 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58769  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3458  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.98 
 
 		 205 aa  195  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.875783 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  44 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  43 
 
 		 201 aa  171  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  43.5 
 
 		 201 aa  171  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  42.5 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0201  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.31 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  43 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  43 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.12 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  42 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  42.29 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  41.5 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  43.28 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  41.29 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  41 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6957  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.08 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.507189  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  42 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  40.5 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  40.5 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  42 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  40.48 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  40.48 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  42.29 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  40 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.95 
 
 		 215 aa  157  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.8 
 
 		 201 aa  157  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  39.3 
 
 		 201 aa  157  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  39.55 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  41 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.29 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  40.3 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  38.68 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  40 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.3 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  40.3 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  40 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  38.21 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  42.79 
 
 		 201 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  39.8 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  38.1 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  40 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  42.79 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  38.86 
 
 		 217 aa  154  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2915  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.21 
 
 		 195 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  42.79 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  39.8 
 
 		 201 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0591  isopropylmalate isomerase small subunit  41.67 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  39.52 
 
 		 216 aa  154  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  37.62 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  38.39 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  37.62 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  37.62 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  37.74 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  37.62 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  39.15 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  37.62 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  37.62 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  37.62 
 
 		 216 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4211  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.1 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  40.2 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  37.62 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  39.5 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  38.1 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  37.62 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  38.1 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  38.1 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  39.52 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2730  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.61 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  39.52 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  38.97 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  38.5 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  39.05 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0629  isopropylmalate isomerase small subunit  41.67 
 
 		 200 aa  151  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  38.28 
 
 		 213 aa  151  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  40 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2068  isopropylmalate isomerase small subunit  40.1 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0374  isopropylmalate isomerase small subunit  40.1 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  39.15 
 
 		 214 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  37.62 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  38.57 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  38.5 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  38.1 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  38.1 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>