More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2764 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2764  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 221 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.74 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.1 
 
 		 240 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  42.73 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.27 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  41.23 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  42.01 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  42.01 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  41.99 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  41.99 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  41.67 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  42.01 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  40.64 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  42.92 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  42.01 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  41.23 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  41.1 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  42.47 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  40.35 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  42.36 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  42.11 
 
 		 218 aa  173  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  41.36 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.82 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  40.87 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  40.69 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  41.23 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  40.87 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  40.87 
 
 		 212 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.85 
 
 		 216 aa  171  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  39.83 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  39.65 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  39.65 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  41.92 
 
 		 215 aa  170  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  42.15 
 
 		 201 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  42.73 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.25 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  39.46 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  39.65 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  40.61 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  40.09 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  39.55 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  39.73 
 
 		 201 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  40.53 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  40.35 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  41.23 
 
 		 216 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0626  isopropylmalate isomerase small subunit  41.63 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0776  isopropylmalate isomerase small subunit  41.63 
 
 		 207 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  43.12 
 
 		 201 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  39.91 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.87 
 
 		 213 aa  168  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  40.09 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  39.21 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  39.13 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  40.09 
 
 		 214 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  40.17 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  42.52 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  40.79 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  39.65 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  42.52 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03088  isopropylmalate isomerase small subunit  41.94 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2801  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  41.36 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0658509  normal  0.244209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0414  isopropylmalate isomerase small subunit  42.52 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000110574 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.61 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  39.91 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  39.27 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.09 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  40.35 
 
 		 216 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  39.21 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  40.43 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  39.65 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  39.21 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.61 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  39.57 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  39.21 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  42.01 
 
 		 201 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  41.3 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  39.21 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.17 
 
 		 215 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  39.57 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  39.21 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  39.21 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  39.57 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  39.21 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  40.09 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0371  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  40.09 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  40.28 
 
 		 194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  41.89 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  42.79 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2731  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  40.09 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.413417  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  40.99 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  39.46 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  39.37 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  39.27 
 
 		 201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  38.46 
 
 		 202 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  40.45 
 
 		 201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3585  isopropylmalate isomerase small subunit  42.86 
 
 		 201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  39.27 
 
 		 201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0474  isopropylmalate isomerase small subunit  41.59 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  43.69 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>