256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2072 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2072  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 322 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0241262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3431  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  70.57 
 
 		 321 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0740  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  65.2 
 
 		 320 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849934 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3938  ornithine cyclodeaminase  65.83 
 
 		 320 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.41875  normal  0.0125846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0820  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  66.35 
 
 		 320 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199129  normal  0.205343 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0365  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  65.22 
 
 		 324 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0848  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  65.22 
 
 		 324 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196428  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2539  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  63.98 
 
 		 323 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.682047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0723  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  64.89 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0970  ornithine cyclodeaminase  52.43 
 
 		 314 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1243  hypothetical protein  52.75 
 
 		 315 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14020  hypothetical protein  52.75 
 
 		 315 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0278351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3566  ornithine cyclodeaminase  51.75 
 
 		 319 aa  291  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296808  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.85 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.52 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  30.99 
 
 		 331 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  24.43 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  29.57 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  26.45 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  26.46 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  27.86 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  26.54 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  25.63 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 342 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  30.72 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  27.64 
 
 		 328 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  28.45 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  27.22 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  23.85 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  24.27 
 
 		 325 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  23.24 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  24.69 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  27.73 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  23.24 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.93 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  24.92 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  25.08 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  23 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  27.05 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  24.11 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  27.1 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  21.77 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.23 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  28.21 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  24.11 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.91 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  27.08 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  28.24 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  20.44 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  26.46 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  28.04 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  23.21 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  23.5 
 
 		 325 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  22.29 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  23.84 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  20.82 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  26.71 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  24.84 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  26.71 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  26.71 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.23 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  27.92 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  26.62 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  26.86 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  24.5 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  25.48 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  20.85 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  27.04 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  23.08 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  23.4 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.6 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  22.76 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  26.22 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  27.01 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3883  ornithine cyclodeaminase  26.25 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  26.8 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  22.39 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  28.69 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  22.22 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  25.11 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  25.31 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  26.43 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  26.59 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.93 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2245  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.06 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2556  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.48 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.370427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  26.53 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.33 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  24.03 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  28.43 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  28.4 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  26.75 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  25.25 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>