151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1622 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  82.67 
 
 
225 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  62.45 
 
 
228 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  53.41 
 
 
301 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  49 
 
 
281 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  47.39 
 
 
260 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  52.28 
 
 
240 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  52.28 
 
 
240 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  52.28 
 
 
240 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  52.28 
 
 
240 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  52.28 
 
 
240 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  52.28 
 
 
240 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  46.67 
 
 
224 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  46.67 
 
 
224 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  46.49 
 
 
224 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  49.12 
 
 
224 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  48 
 
 
224 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  31.46 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  32.35 
 
 
251 aa  119  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  35.25 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  35.25 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  35.25 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  35.25 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  35.25 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  35.25 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  35.25 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  33.49 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  36.67 
 
 
251 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  32.16 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  29.36 
 
 
253 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  34.13 
 
 
255 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0119  hypothetical protein  25.78 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  32.49 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.69 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.02 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.13 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  26.84 
 
 
265 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  24.46 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  26.41 
 
 
265 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0103  hypothetical protein  21.14 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0106  hypothetical protein  21.16 
 
 
272 aa  60.1  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  30.59 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  30.81 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  29.11 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  27.6 
 
 
268 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  26.62 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2025  protein of unknown function DUF218  23.08 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0343136  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  38.32 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  25.88 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  34.69 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  29.38 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.69 
 
 
266 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  33.06 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  31.25 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  26.75 
 
 
230 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  32.37 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  32.85 
 
 
262 aa  52.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  28.51 
 
 
262 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  26.79 
 
 
287 aa  52.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 
334 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  28.38 
 
 
256 aa  52  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  28.42 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.41 
 
 
256 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  31.33 
 
 
192 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  31.46 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  32.82 
 
 
336 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  31.68 
 
 
199 aa  50.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  31.43 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1256  hypothetical protein  27.01 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1451  hypothetical protein  27.49 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00698749  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  25.62 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.04 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  26.38 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.9 
 
 
280 aa  49.7  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  29.41 
 
 
282 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  31.02 
 
 
264 aa  49.3  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  35.06 
 
 
228 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  25.82 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.82 
 
 
237 aa  49.3  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.74 
 
 
242 aa  49.3  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  31.02 
 
 
266 aa  48.9  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  26.57 
 
 
273 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  31.03 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  28.76 
 
 
278 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  27.22 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  28.31 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  23.26 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.82 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  30.17 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  26.74 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1939  hypothetical protein  28.46 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  26.55 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  29.24 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19360  hypothetical protein  29.9 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  28.67 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  34.83 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  24.68 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0069  protein of unknown function DUF218  31.39 
 
 
333 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>