52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7157 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7157  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  100 
 
 		 137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.138064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3902  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  43.88 
 
 		 192 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.625639  normal  0.114917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4295  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  39.16 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.441473  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5974  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  37.01 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858735  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0918  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  35.62 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6573  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  38.3 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2011  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  38.3 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7313  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  38.3 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.234641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1180  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  38.51 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.390609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2600  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  35.57 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3170  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  35.1 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.402243  normal  0.0218812 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0932  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.97 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3459  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  36.81 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1992  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  37.06 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.129722  normal  0.402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1823  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  36.36 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.199401  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1693  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  34.23 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.235962  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1071  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  36.57 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0777291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1419  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.62 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0819714  normal  0.118637 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2116  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  33.8 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0732006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1425  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  35.29 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.987812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0271  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.48 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0794  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  33.56 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1415  phage cell wall peptidase, NlpC/P60 family  33.33 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.671404  normal  0.0714163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2478  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.507905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4979  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.87 
 
 		 194 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1143  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  34.29 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0669271  normal  0.758995 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1646  NLP/P60 protein  32.59 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4081  NLP/P60 protein  32.59 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0487119  normal  0.0206777 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0599  NLP/P60 family protein  31.88 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1088  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  35.46 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242256  normal  0.0459269 
 
 
-
 
NC_004310  BR0600  NLP/P60 family protein  31.88 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0781347  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2888  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  32.86 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0230434  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2164  hypothetical protein  31.58 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2488  hypothetical protein  30.82 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  33.91 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3057  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  31.01 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  35.29 
 
 		 283 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4018  hypothetical protein  32.33 
 
 		 373 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0554525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2725  putative phage associated protein  29.46 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00000399929  normal  0.0320928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1352  hypothetical protein  32.98 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  29.82 
 
 		 327 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14530  glucan-binding domain-containing protein  35.78 
 
 		 602 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.259034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  24.58 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  30.08 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  34 
 
 		 289 aa  42  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1645  putative phage cell wall peptidase, NlpC/P60  28.47 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  33.94 
 
 		 270 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  32.11 
 
 		 333 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  30.09 
 
 		 300 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  29.51 
 
 		 281 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  27.43 
 
 		 302 aa  40  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>