138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6301 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6301  NMT1/THI5-like domain-containing protein  100 
 
 
325 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2778  NMT1/THI5 like domain protein  40.58 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1180  putative ABC transporter, periplasmic protein  37.54 
 
 
323 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0619  NMT1/THI5 like domain protein  30.59 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5352  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.67 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5441  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.67 
 
 
329 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.558403 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5731  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.67 
 
 
329 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1528  ABC transporter substrate-binding protein  24.89 
 
 
357 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2782  ABC transporter substrate-binding protein  21.93 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.1 
 
 
364 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000374426  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3083  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  24.54 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2293  membrane lipoprotein lipid attachment site  20.86 
 
 
336 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1836  ABC-type nitrate/sulfonate/taurine/bicarbonate transport systems, periplasmic component  23.74 
 
 
340 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6066  ABC transporter substrate-binding protein  23.31 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.26 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0655  NMT1/THI5-like protein  23.81 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1678  NMT1/THI5 like domain protein  25.5 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00877169  normal  0.68258 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3454  ABC transporter, substrate-binding protein  20.61 
 
 
334 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2564  putative ABC transporter, periplasmic subunit  26 
 
 
334 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  20.3 
 
 
337 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1411  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  24.7 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.214398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 
915 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3812  NMT1/THI5 like domain protein  26.09 
 
 
365 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.424332 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5036  ABC transporter substrate-binding protein  19.57 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.647768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4613  NMT1/THI5-like domain-containing protein  19.58 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11510  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  22.77 
 
 
336 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000048144  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4675  ABC transporter substrate-binding protein  19.57 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0288  NMT1/THI5 like domain protein  27.59 
 
 
327 aa  57  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  hitchhiker  0.0000957197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3213  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.62 
 
 
338 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4901  putative ABC transporter, substrate-binding protein  19.3 
 
 
335 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3147  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  23.89 
 
 
344 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0449  NMT1/THI5 like domain protein  25.11 
 
 
327 aa  56.6  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0337  putative ABC transporter, substrate-binding protein  19.3 
 
 
335 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4533  ABC transporter, substrate-binding protein  19.57 
 
 
335 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3333  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
341 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.686225  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6283  NMT1/THI5 like domain protein  23.28 
 
 
381 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3549  ABC transporter substrate-binding protein  26.53 
 
 
339 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0121  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  24.44 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4514  ABC transporter, substrate-binding protein  20 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  27.34 
 
 
674 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2117  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  22.92 
 
 
342 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4921  putative ABC transporter, substrate-binding protein  20 
 
 
335 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4663  NMT1/THI5 like domain protein  27.96 
 
 
338 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.679325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2108  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
341 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4900  putative ABC transporter, substrate-binding protein  19.2 
 
 
335 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2205  ABC transporter substrate-binding protein  21.78 
 
 
324 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1374  NMT1/THI5 like domain protein  30.21 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.353892  normal  0.853253 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2024  NMT1/THI5 like domain protein  26.67 
 
 
344 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4935  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  19.65 
 
 
325 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.14 
 
 
333 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0229  NMT1/THI5 like domain protein  25.34 
 
 
391 aa  52.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0038  NMT1/THI5 like domain protein  32.12 
 
 
336 aa  52.8  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4526  NMT1/THI5-like domain-containing protein  21.43 
 
 
336 aa  52.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2511  diguanylate cyclase  22.07 
 
 
686 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0260  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 
331 aa  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.388479  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.45 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0878  hypothetical protein  21.38 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0057402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34300  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, periplasmic component  26.89 
 
 
319 aa  50.8  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2085  hydroxymethylpyrimidine-binding protein  22.17 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2762  membrane lipoprotein lipid attachment site  24.81 
 
 
347 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2575  hypothetical protein  20.67 
 
 
336 aa  50.1  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.225151  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0179  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  27.27 
 
 
326 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.907617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0856  hypothetical protein  26.22 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.028683  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1812  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems, periplasmic components TauA  27.27 
 
 
326 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.661868  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4669  NMT1/THI5 like domain protein  26.63 
 
 
335 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0670  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  24.51 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0360642 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1466  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  28.1 
 
 
326 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4102  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.64 
 
 
336 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000394257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3120  twin-arginine translocation pathway signal  25.18 
 
 
340 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4058  twin-arginine translocation pathway signal  28.76 
 
 
329 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0667  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.61 
 
 
329 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2254  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
336 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  26.13 
 
 
778 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3589  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.64 
 
 
346 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1033  hypothetical protein  25.61 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152767  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2402  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  20.88 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.150141  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.55 
 
 
328 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140791  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5012  ABC transporter substrate-binding protein  23.88 
 
 
343 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2979  NMT1/THI5-like domain-containing protein  24.58 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4758  NMT1/THI5 like domain protein  26.42 
 
 
328 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6358  putative sulfonate ABC transporter, substrate-binding protein  23.93 
 
 
324 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2258  NMT1/THI5 like domain protein  24.14 
 
 
340 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  23.05 
 
 
375 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2255  NMT1/THI5 like domain protein  24.26 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0284  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  21.69 
 
 
346 aa  47  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1304  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic protein  24.08 
 
 
417 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165264  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2047  hypothetical protein  27.14 
 
 
326 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0745441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  18.84 
 
 
1075 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1861  NMT1/THI5 like domain protein  24.45 
 
 
339 aa  46.6  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0354  NMT1/THI5 like domain protein  25.56 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6030  putative ABC transporter, substrate binding protein  29.69 
 
 
329 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.45 
 
 
343 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3456  hypothetical protein  27.19 
 
 
336 aa  46.2  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2525  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.65 
 
 
321 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.610523  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2570  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.65 
 
 
321 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0469  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.92 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0465  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  27.73 
 
 
347 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.176308  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1273  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.81 
 
 
1004 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2477  NMT1/THI5 like domain protein  23 
 
 
331 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0408  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.92 
 
 
438 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>