More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5691 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  67.21 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3179  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00699153  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5088  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5188  response regulator receiver protein  54.46 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701464 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  46.9 
 
 		 133 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2885  response regulator receiver domain-containing protein  48.11 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7266  response regulator receiver protein  48.62 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6166  response regulator receiver protein  46.3 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2406  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 124 aa  103  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  44.83 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  43.36 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 128 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  44.55 
 
 		 137 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  44.66 
 
 		 256 aa  94.7  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  41.35 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  40.52 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  44.23 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6494  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5741  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621186  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 230 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  44 
 
 		 117 aa  87  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 209 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 211 aa  84.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5521  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  41.51 
 
 		 233 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 230 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  40.82 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  40.82 
 
 		 122 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5317  two-component response regulator  41.67 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000227819  normal  0.530809 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  40.38 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 330 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  40.2 
 
 		 209 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5182  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 213 aa  80.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2318  response regulator receiver protein  45.54 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.72 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  39.22 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  37.14 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  38.68 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0231  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 330 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2455  response regulator receiver domain-containing protein  45.78 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 220 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  33.88 
 
 		 210 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 212 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  37.5 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  38.6 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  37.25 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  41.75 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.84 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  39.8 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1518  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 207 aa  73.9  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6678  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.61 
 
 		 207 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 228 aa  73.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  34.26 
 
 		 205 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.21 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6901  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279255  normal  0.546779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0944  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0583  response regulator receiver protein  40 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>