More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3215 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  808    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  67.99 
 
 		 406 aa  535  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  64.5 
 
 		 413 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  62.5 
 
 		 413 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  60.64 
 
 		 487 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  60 
 
 		 431 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1351  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  57.61 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0854503  normal  0.0233504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  49.25 
 
 		 416 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1917  major facilitator family transporter  53.62 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.405488  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 420 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 418 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  40.82 
 
 		 404 aa  339  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 410 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 399 aa  332  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 		 406 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  41.07 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  40.25 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  41.07 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  40.82 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  40.82 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  40.82 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  40.82 
 
 		 404 aa  322  6e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  40.56 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  40.82 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 411 aa  282  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 397 aa  279  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 397 aa  279  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  36.59 
 
 		 402 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01049  predicted drug efflux system  40.45 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  40.45 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1174  drug efflux system protein MdtG  40.45 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.571838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  40.45 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1175  drug efflux system protein MdtG  41.19 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.504278  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  40.2 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 410 aa  266  5e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1250  drug efflux system protein MdtG  41.19 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2035  drug efflux system protein MdtG  41.19 
 
 		 404 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  36.57 
 
 		 411 aa  263  4.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1221  drug efflux system protein MdtG  40.94 
 
 		 404 aa  262  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1265  drug efflux system protein MdtG  40.94 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2219  drug efflux system protein MdtG  40.69 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0478  major facilitator superfamily transporter  34.61 
 
 		 403 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 403 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3167  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1774  major facilitator superfamily permease  34.53 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179467 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0693  major facilitator superfamily permease  34.85 
 
 		 405 aa  232  9e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.883245  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1079  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 407 aa  225  9e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000078531  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  33.5 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  33.84 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  36.15 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0468  multidrug resistance efflux transporter  30.87 
 
 		 394 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000018519  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  31.38 
 
 		 398 aa  209  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1273  multidrug resistance efflux transporter, authentic frameshift  30.87 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 407 aa  182  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1485  multi-drug resistance protein  32.99 
 
 		 389 aa  177  4e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00168356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 407 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  28.72 
 
 		 401 aa  159  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0507  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 450 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0233513  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0110  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0106  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3681  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  35.85 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 414 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1114  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  27.53 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1278  hypothetical protein  25.69 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3901  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.46 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.46 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  22.91 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0173  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  22.19 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  24.55 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  26.63 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>