More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2764 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  100 
 
 
308 aa  624  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  90.97 
 
 
310 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  90.65 
 
 
310 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  88.64 
 
 
308 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  88.64 
 
 
308 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  87.99 
 
 
308 aa  547  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  88.31 
 
 
308 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  88.64 
 
 
308 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  88.31 
 
 
308 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  87.66 
 
 
308 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  84.42 
 
 
313 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  84.42 
 
 
308 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  84.42 
 
 
313 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  84.42 
 
 
313 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  85.06 
 
 
308 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  85.06 
 
 
308 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  85.06 
 
 
308 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  85.06 
 
 
336 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  79.53 
 
 
321 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  79.53 
 
 
321 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  77.85 
 
 
321 aa  471  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  76.51 
 
 
316 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  75.84 
 
 
316 aa  464  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  63.38 
 
 
334 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  62.21 
 
 
305 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  64.31 
 
 
298 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  61.89 
 
 
319 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  61.89 
 
 
305 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  60.88 
 
 
319 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  62.95 
 
 
325 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  62.01 
 
 
325 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  61.18 
 
 
319 aa  358  5e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  58.97 
 
 
315 aa  358  8e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  58.86 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  60.4 
 
 
343 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  59.08 
 
 
309 aa  353  2e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  59.2 
 
 
297 aa  353  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  73.89 
 
 
250 aa  351  8e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  60.61 
 
 
302 aa  349  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3396  ABC transporter related  71.79 
 
 
239 aa  345  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 
306 aa  308  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  55.33 
 
 
306 aa  308  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  49.68 
 
 
336 aa  277  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  49 
 
 
309 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  51.49 
 
 
308 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  48.84 
 
 
309 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  48.03 
 
 
320 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  47.88 
 
 
333 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  48.48 
 
 
326 aa  263  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  48.84 
 
 
309 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  48.17 
 
 
309 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  45.48 
 
 
319 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  46.91 
 
 
318 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  47.83 
 
 
307 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  46.43 
 
 
321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  44.44 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  44.85 
 
 
319 aa  249  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  42.45 
 
 
309 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  42.81 
 
 
308 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  40.39 
 
 
308 aa  245  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  42.38 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  43.23 
 
 
308 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  43.14 
 
 
308 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  42.42 
 
 
312 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  41.12 
 
 
318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  41.69 
 
 
308 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  40.53 
 
 
306 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  42.48 
 
 
315 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  40.46 
 
 
307 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 
308 aa  236  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  41.78 
 
 
308 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  41.83 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  41.39 
 
 
306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  43.97 
 
 
341 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  40.91 
 
 
308 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  41.29 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  41.12 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  41.12 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  39.34 
 
 
319 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  43 
 
 
304 aa  232  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  40.97 
 
 
308 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  44.85 
 
 
319 aa  232  6e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  41.45 
 
 
318 aa  232  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  39.53 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1331  ABC transporter related  40.51 
 
 
340 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  40.53 
 
 
306 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  41.42 
 
 
333 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  40.33 
 
 
306 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  39.14 
 
 
306 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  41.06 
 
 
318 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  40.72 
 
 
314 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  40.58 
 
 
309 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  49.1 
 
 
304 aa  228  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 
304 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 
306 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
304 aa  227  2e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  43 
 
 
355 aa  226  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  39.4 
 
 
308 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  39.74 
 
 
309 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>