More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2366 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 431 aa  866    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  72.68 
 
 		 436 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  72.68 
 
 		 436 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  72.68 
 
 		 436 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  65.89 
 
 		 432 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  64.27 
 
 		 430 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  63.81 
 
 		 432 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  60.19 
 
 		 435 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  55.35 
 
 		 436 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  55.53 
 
 		 429 aa  441  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  54.12 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  52.22 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  50.94 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  54.35 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  47.34 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  47.1 
 
 		 430 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 		 433 aa  356  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 427 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  39.67 
 
 		 434 aa  276  7e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 435 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  44.33 
 
 		 427 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  38.66 
 
 		 427 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 		 428 aa  263  6e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 436 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 		 427 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 427 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 433 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 		 434 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  39.37 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  41.73 
 
 		 423 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  37.59 
 
 		 429 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  38.48 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  38.24 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 		 423 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  35.06 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  40.39 
 
 		 432 aa  243  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  34.82 
 
 		 478 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 428 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  37.5 
 
 		 428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 		 433 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 428 aa  226  8e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 434 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  35.61 
 
 		 432 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 431 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 428 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 427 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  34.59 
 
 		 427 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  32.94 
 
 		 437 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 430 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 434 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  32.31 
 
 		 428 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 428 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 428 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 433 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  32.24 
 
 		 430 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  33.1 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 437 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  33.1 
 
 		 428 aa  195  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  33.1 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 436 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  33.64 
 
 		 430 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.1 
 
 		 439 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  32.63 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.41 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  35.96 
 
 		 423 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 428 aa  193  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  33.1 
 
 		 430 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 428 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  33.64 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 436 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 429 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  31.99 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>