285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0696 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0365  histidine ammonia-lyase protein  75.57 
 
 		 528 aa  786    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3058  Histidine ammonia-lyase  86.23 
 
 		 531 aa  897    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244437  normal  0.468867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0933  histidine ammonia-lyase  85.69 
 
 		 531 aa  898    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3690  Histidine ammonia-lyase  76.6 
 
 		 532 aa  794    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.235909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3604  histidine ammonia-lyase  77.67 
 
 		 540 aa  789    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4079  histidine ammonia-lyase  77.93 
 
 		 540 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4767  Histidine ammonia-lyase  76.6 
 
 		 532 aa  794    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0696  histidine ammonia-lyase  100 
 
 		 531 aa  1060    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.247937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2097  putative phenylalanine and histidine ammonia-lyase  60.36 
 
 		 511 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0433  histidine ammonia-lyase  63.35 
 
 		 514 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.421734  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5099  histidine ammonia-lyase  62.15 
 
 		 515 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004070  putative histidine ammonia-lyase protein  59.8 
 
 		 517 aa  598  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0334  histidine ammonia-lyase  59.16 
 
 		 524 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0344  Histidine ammonia-lyase  59.16 
 
 		 524 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3894  histidine ammonia-lyase  59.49 
 
 		 520 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3682  histidine ammonia-lyase  58.48 
 
 		 521 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0335  histidine ammonia-lyase  58.67 
 
 		 521 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3385  histidine ammonia-lyase  60.48 
 
 		 518 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4374  histidine ammonia-lyase, putative  59.4 
 
 		 521 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3917  Histidine ammonia-lyase  61.54 
 
 		 516 aa  581  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4602  histidine ammonia-lyase  59 
 
 		 520 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0341  histidine ammonia-lyase  59.16 
 
 		 524 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0344  histidine ammonia-lyase  58.28 
 
 		 521 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0440  histidine ammonia-lyase  58.96 
 
 		 524 aa  580  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0336  histidine ammonia-lyase  59.16 
 
 		 524 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0319  histidine ammonia-lyase  58.22 
 
 		 519 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3517  histidine ammonia-lyase  58.81 
 
 		 520 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0346  histidine ammonia-lyase  58.13 
 
 		 520 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1493  histidine ammonia-lyase  57.6 
 
 		 528 aa  528  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1004  histidine ammonia-lyase  55.71 
 
 		 511 aa  472  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1739  histidine ammonia-lyase  46.32 
 
 		 540 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0504276  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2100  Histidine ammonia-lyase  38.31 
 
 		 506 aa  352  7e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.742881  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5061  Histidine ammonia-lyase  43.1 
 
 		 715 aa  346  7e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.14793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  38.23 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  34.8 
 
 		 507 aa  290  6e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  36.23 
 
 		 508 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  35.89 
 
 		 516 aa  284  3.0000000000000004e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  37.15 
 
 		 509 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0175  histidine ammonia-lyase  36.6 
 
 		 567 aa  276  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  35.09 
 
 		 489 aa  272  1e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  37.22 
 
 		 504 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3988  histidine ammonia-lyase  36.11 
 
 		 567 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  38.25 
 
 		 526 aa  269  8e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2124  histidine ammonia-lyase  31.51 
 
 		 513 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0231  histidine ammonia-lyase  36.21 
 
 		 533 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1999  Histidine ammonia-lyase  33.26 
 
 		 509 aa  266  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3574  histidine ammonia-lyase  36.68 
 
 		 523 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183418  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  32.93 
 
 		 505 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  32.93 
 
 		 505 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  32.93 
 
 		 505 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  32.8 
 
 		 506 aa  263  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  33 
 
 		 505 aa  263  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  32.8 
 
 		 505 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  37.2 
 
 		 514 aa  262  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  32.8 
 
 		 505 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  32.8 
 
 		 505 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  32.53 
 
 		 505 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3256  histidine ammonia-lyase  36.63 
 
 		 523 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0008  histidine ammonia-lyase  31.58 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0008  histidine ammonia-lyase  31.58 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  35.24 
 
 		 508 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2576  histidine ammonia-lyase  31.36 
 
 		 523 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1047  Histidine ammonia-lyase  32.53 
 
 		 502 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  39.2 
 
 		 507 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  33.4 
 
 		 509 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1109  histidine ammonia-lyase  31.58 
 
 		 506 aa  257  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  32.4 
 
 		 505 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2092  histidine ammonia-lyase  37.96 
 
 		 535 aa  257  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  32.8 
 
 		 505 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  35.24 
 
 		 498 aa  254  3e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  36.67 
 
 		 518 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1747  histidine ammonia-lyase  39.23 
 
 		 508 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000510266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  35.43 
 
 		 520 aa  253  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  39.22 
 
 		 529 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  39.22 
 
 		 529 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  39.22 
 
 		 533 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4658  histidine ammonia-lyase  37.58 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0234611  normal  0.0199218 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  39.78 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  39.78 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0850  histidine ammonia-lyase  33.86 
 
 		 519 aa  251  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.03365 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  39.78 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  33.81 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  34.95 
 
 		 510 aa  252  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  35.22 
 
 		 510 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  39 
 
 		 514 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  37.26 
 
 		 517 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  39.78 
 
 		 507 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  38.04 
 
 		 516 aa  250  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  36.49 
 
 		 511 aa  249  7e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1853  Histidine ammonia-lyase  32.11 
 
 		 512 aa  249  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1435  histidine ammonia-lyase  36.51 
 
 		 511 aa  249  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  35.2 
 
 		 512 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  34.28 
 
 		 511 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1098  histidine ammonia-lyase  40 
 
 		 506 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  34.41 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1820  histidine ammonia-lyase  35.69 
 
 		 530 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  36.19 
 
 		 511 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0872  histidine ammonia-lyase  36.72 
 
 		 511 aa  246  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0930  histidine ammonia-lyase  36.51 
 
 		 511 aa  246  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  34.23 
 
 		 513 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>