More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1955 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1955  ribosomal protein L1  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  55.2 
 
 		 231 aa  255  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  55.66 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  57.08 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  57.01 
 
 		 232 aa  241  6e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0394  50S ribosomal protein L1  49.54 
 
 		 226 aa  241  6e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.351464  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  53.36 
 
 		 233 aa  241  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  53.12 
 
 		 232 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  53.85 
 
 		 235 aa  240  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  50.89 
 
 		 231 aa  238  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  52.49 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 229 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  53.1 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  51.57 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  53.18 
 
 		 231 aa  231  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  54.75 
 
 		 235 aa  231  8.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2424  50S ribosomal protein L1  48.64 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.551126  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 229 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  51.56 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  50.89 
 
 		 233 aa  231  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  50.23 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  50.68 
 
 		 233 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  52.21 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  50.45 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 231 aa  228  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  49.11 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  48.66 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  48.21 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  48.21 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  48.21 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  50.67 
 
 		 232 aa  224  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  50.23 
 
 		 231 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  48.66 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  47.27 
 
 		 235 aa  223  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  48.87 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  48.66 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  48.66 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1489  ribosomal protein L1  50.22 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0841065  normal  0.34693 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  48.64 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  50 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  48.46 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  49.77 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  49.77 
 
 		 231 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  47.11 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  47.11 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  51.79 
 
 		 229 aa  220  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  50.24 
 
 		 233 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  47.93 
 
 		 241 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  47.06 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0480  50S ribosomal protein L1  52.04 
 
 		 233 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.841279  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  46.67 
 
 		 238 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 		 232 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  46.88 
 
 		 232 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  47.37 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  45.78 
 
 		 238 aa  218  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  47.64 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0465  50S ribosomal protein L1  51.58 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00222885  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  51.18 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  51.18 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  47.35 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  51.18 
 
 		 234 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  47.73 
 
 		 232 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0395  50S ribosomal protein L1P  48.21 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.00704539 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 230 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1944  50S ribosomal protein L1  50.44 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.160034  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4679  50S ribosomal protein L1  48.02 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000682303  decreased coverage  0.0030741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  48.89 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  48.44 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  47.51 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  47.51 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  47.96 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  48.21 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  47.51 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2784  ribosomal protein L1  42.92 
 
 		 234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0008683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  44.25 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_004310  BR1247  50S ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123881  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1208  50S ribosomal protein L1  49.56 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  47.06 
 
 		 232 aa  214  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  46.46 
 
 		 242 aa  214  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  46.35 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3348  50S ribosomal protein L1  49.55 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  46.82 
 
 		 234 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4286  50S ribosomal protein L1  49.09 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185505  hitchhiker  0.000000513776 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0269  50S ribosomal protein L1  53.57 
 
 		 230 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0927887  hitchhiker  0.00154879 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0756  50S ribosomal protein L1  49.78 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  48.66 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>