More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3669 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3669  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
338 aa  684    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  63.99 
 
 
339 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5229  AraC family transcriptional regulator  62.8 
 
 
339 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0958531  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1198  AraC family transcriptional regulator  38.17 
 
 
348 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.462338  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1176  AraC family transcriptional regulator  35.12 
 
 
345 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13099  virulence-regulating transcriptional regulator VirS  33.94 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13768  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 
353 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3849  helix-turn-helix, Fis-type  29.82 
 
 
352 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5049  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 
351 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4629  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 
363 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1284  helix-turn-helix domain-containing protein  30.33 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2010  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0421  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
350 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5495  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.26 
 
 
309 aa  126  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143439  normal  0.457572 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3839  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 
358 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.565712  normal  0.744721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3952  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 
358 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.142509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  30.15 
 
 
365 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1732  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
340 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570541  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2149  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 
365 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3846  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4713  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2142  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179718  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2005  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2814  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.323358  normal  0.871008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1606  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
358 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2671  helix-turn-helix domain-containing protein  26.19 
 
 
343 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2761  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 
359 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1666  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1715  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 
375 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3901  helix-turn-helix, AraC type  26.53 
 
 
366 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5295  AraC family transcriptional regulator  25.37 
 
 
347 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0712927 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  26.2 
 
 
390 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 
332 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 
347 aa  103  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5052  AraC family transcriptional regulator  23.65 
 
 
333 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0267  HTH-type transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 
335 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.128312  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  30.42 
 
 
365 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
345 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3048  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 
342 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.428431  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  27.47 
 
 
362 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  28.13 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 
353 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4632  AraC family transcriptional regulator  24.56 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0442658  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0045  helix-turn-helix domain-containing protein  31.51 
 
 
373 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  31.08 
 
 
360 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 
346 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 
347 aa  96.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  25.42 
 
 
352 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  28.28 
 
 
372 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1288  transcriptional regulator, AraC family  31.16 
 
 
373 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  26.59 
 
 
357 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 
337 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 
336 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  26.15 
 
 
340 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  26.52 
 
 
336 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
353 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 
337 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  27.08 
 
 
366 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 
366 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6033  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.695454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0302  AraC family transcriptional regulator  23.51 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5669  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 
329 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
342 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1565  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 
361 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  0.143942 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 
364 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6523  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 
329 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.317039 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 
364 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  27.53 
 
 
353 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2600  AraC family transcriptional regulator  26.27 
 
 
351 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.867319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0307  AraC family transcriptional regulator  22.62 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  21.56 
 
 
348 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  25.39 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  33.5 
 
 
337 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 
342 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 
367 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  21.6 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1252  transcriptional regulator, AraC family  24.55 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3717  AraC family transcriptional regulator  22.83 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  23.19 
 
 
334 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1593  helix-turn-helix domain-containing protein  26.65 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  25.07 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2261  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 
327 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3805  transcriptional regulator, AraC family  26.99 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256933  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0530  helix-turn-helix domain-containing protein  27.55 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3303  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0702064  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2307  Helix-turn-helix, AraC domain protein  22.67 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2543  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.354483  hitchhiker  0.0000426703 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1673  helix-turn-helix, AraC type  26.48 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642635  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  22.48 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 
337 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05257  hypothetical protein  24.17 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>