More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3381 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3381  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5227  LysR family transcriptional regulator  92.57 
 
 		 296 aa  540  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0300  LysR family transcriptional regulator  90.14 
 
 		 296 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4696  LysR family transcriptional regulator  91.55 
 
 		 296 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.580635  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4922  LysR family transcriptional regulator  90.41 
 
 		 296 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3018  LysR family transcriptional regulator  90.41 
 
 		 296 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5348  LysR family transcriptional regulator  90.41 
 
 		 296 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0816999  normal  0.420046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1349  LysR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000462626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28420  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 295 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000459447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2479  putative transcriptional regulator  44.91 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4338  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2250  LysR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.75776  normal  0.514799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1881  LysR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.407477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1724  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.251879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3488  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0702962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0402  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 295 aa  205  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0169  transcriptional regulator, LysR family  42.91 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0195  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4291  transcriptional regulator, LysR family  43.87 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.70034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0137  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0155  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0216  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4156  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3727  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.837668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1712  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  39.05 
 
 		 341 aa  139  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  36.46 
 
 		 307 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 322 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1639  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2728  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4563  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1683  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1614  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1689  LysR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0510  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0567  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7442  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2841  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0545664  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1535  transcriptional regulator, LysR family  27.91 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2823  LysR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1724  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2966  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.812249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1149  LysR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.229306  normal  0.0812943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  34.85 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1136  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2058  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  0.839188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1907  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1677  LysR substrate-binding  30.58 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1996  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5540  LysR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0161  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 297 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0599648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3742  putative transcriptional regulator  29.5 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3184  LysR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.72 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3588  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6422  LysR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4052  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1185  transcriptional regulator, LysR family  25.57 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0421  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 291 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3183  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3327  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 295 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5866  transcriptional regulator, LysR family  31.66 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0943  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0612  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3141  LysR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4046  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 307 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4539  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.28189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4323  LysR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 284 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3125  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1351  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3833  LysR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.450115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1825  transcriptional regulator, LysR family protein  25.88 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.401328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0141  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0697  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4116  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2212  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2083  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.163485  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1303  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6997  LysR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 321 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4003  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.684934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1342  LysR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00332672  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1142  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2531  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1150  LysR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.529975  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3798  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>