89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3228 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
283 aa  577  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  93.59 
 
 
282 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  92.88 
 
 
282 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  92.53 
 
 
282 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  92.88 
 
 
282 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  92.53 
 
 
282 aa  534  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  91.81 
 
 
282 aa  532  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  67.78 
 
 
279 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  68.8 
 
 
284 aa  380  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  67.92 
 
 
274 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  62.93 
 
 
278 aa  346  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  63.32 
 
 
266 aa  344  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  45.79 
 
 
287 aa  208  8e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.05 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.4 
 
 
264 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  37.73 
 
 
278 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3366  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.92 
 
 
288 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.63 
 
 
276 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4327  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.63 
 
 
276 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123683  normal  0.0438049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5715  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.33 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2735  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.17 
 
 
277 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.47 
 
 
394 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.03 
 
 
394 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5816  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.49 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5044  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.49 
 
 
277 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4363  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.49 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6836  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.21 
 
 
277 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0909403  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.72 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.47 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  30.26 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.04 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5713  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.55 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.04 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.04 
 
 
257 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.57 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.29 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.29 
 
 
257 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.61 
 
 
257 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  29.05 
 
 
256 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  29.05 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.1 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  29.05 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  29.05 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  29.05 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43737  phytanoyl-coa dioxygenase  24.56 
 
 
409 aa  63.5  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.15 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.46 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.1 
 
 
273 aa  62.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.63 
 
 
306 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  28.63 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.73 
 
 
239 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.63 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  23.53 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.78 
 
 
253 aa  57  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_85999  predicted protein  21.61 
 
 
407 aa  57  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.41 
 
 
253 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.3 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  35.62 
 
 
267 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4738  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.48 
 
 
280 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.399659  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3661  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.48 
 
 
280 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.305414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.34 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 
320 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.36 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  27.59 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.41 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 
273 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 
275 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.37 
 
 
275 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.9 
 
 
303 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48320  predicted protein  25.73 
 
 
410 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  23.44 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.33 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.9 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.9 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  23.72 
 
 
281 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.82 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.55 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.85 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.67 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.62 
 
 
280 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.24 
 
 
259 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.75 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.95 
 
 
278 aa  43.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.47 
 
 
261 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.99 
 
 
230 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.54 
 
 
285 aa  42.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>