43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2605 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2605  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
191 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  34.82 
 
 
427 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  33.06 
 
 
842 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 
320 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 
686 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  26.15 
 
 
883 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  32.48 
 
 
1332 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 
465 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  30.25 
 
 
907 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  28.46 
 
 
288 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 
334 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  27.91 
 
 
264 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  32.74 
 
 
306 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  33.93 
 
 
608 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 
277 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3127  glycoside hydrolase family 16  28.91 
 
 
275 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  28.03 
 
 
283 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  26.61 
 
 
268 aa  48.5  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  23.81 
 
 
383 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6754  glycoside hydrolase family protein  29.05 
 
 
284 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3399  glycoside hydrolase family 16  28.12 
 
 
275 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.117609 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.57 
 
 
547 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  26.39 
 
 
1059 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1873  glycoside hydrolase family 16  28.67 
 
 
287 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  25.68 
 
 
409 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  30.28 
 
 
475 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  24.53 
 
 
289 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 
272 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  24.19 
 
 
269 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126867 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0392  glycoside hydrolase family 16  32.73 
 
 
691 aa  45.1  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_4167  predicted protein  24.47 
 
 
248 aa  44.7  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.512731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0805  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
295 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  30 
 
 
588 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  22.88 
 
 
423 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 
642 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.14 
 
 
261 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  25.97 
 
 
286 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 
641 aa  42.4  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1119  endo-beta-galactosidase, GlcNAc-alpha-1,4-Gal-releasing  29.46 
 
 
420 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.308798  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 
346 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25 
 
 
282 aa  41.6  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 
394 aa  41.6  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 
694 aa  41.2  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>