26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_4167 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_4167  predicted protein  100 
 
 
248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.512731 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_25832  cell wall protein in family of putative glycosidases Probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase  54.84 
 
 
413 aa  274  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.623887  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03914  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  44.98 
 
 
375 aa  185  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.349103 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00933  extracellular cell wall glucanase Crf1/allergen Asp F9 (AFU_orthologue; AFUA_1G16190)  37.86 
 
 
405 aa  176  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0489883  normal  0.840082 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03053  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  39.67 
 
 
364 aa  157  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736555  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06948  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  41.45 
 
 
367 aa  150  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04515  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  38.79 
 
 
435 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000384453  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05790  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  30.41 
 
 
376 aa  88.2  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40512  predicted protein  33.52 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2802  b-glucosidase  31.91 
 
 
345 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.790099  normal  0.396341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4600  glycoside hydrolase family protein  32.06 
 
 
277 aa  62.8  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  24.86 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 
593 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4988  glycoside hydrolase family protein  27.12 
 
 
372 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  32.12 
 
 
334 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  33.06 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126867 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  25.16 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  21.59 
 
 
264 aa  45.8  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  25.16 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  25.3 
 
 
423 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2605  glycoside hydrolase family protein  24.47 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0648  glycoside hydrolase family protein  28.79 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0544  glycoside hydrolase family 16  23.03 
 
 
238 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.673841 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  23.11 
 
 
642 aa  42.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  24.07 
 
 
291 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  23.11 
 
 
641 aa  42.4  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>