246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3788 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3788  chromosome segregation and condensation protein ScpB  100 
 
 		 221 aa  441  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2840  chromosome segregation and condensation protein ScpB  72.85 
 
 		 223 aa  306  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4197  condensin subunit ScpB  51.4 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323674  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4583  putative transcriptional regulator  56.22 
 
 		 232 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4574  putative transcriptional regulator  56.04 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4550  putative transcriptional regulator  58.24 
 
 		 245 aa  207  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7277  hypothetical protein  48.88 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4816  putative transcriptional regulator  53.89 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8008  hypothetical protein  52.17 
 
 		 231 aa  193  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915827  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4800  putative transcriptional regulator  51.89 
 
 		 241 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.172274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4029  chromosome segregation and condensation protein ScpB  52.97 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3753  chromosome segregation and condensation protein ScpB  52.97 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.352039  normal  0.566096 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4509  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.831717  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4232  hypothetical protein  51.09 
 
 		 197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3402  putative transcriptional regulator  48.57 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0776378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9010  hypothetical protein  50.45 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4409  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0902178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1724  putative segregation and condensation protein B  38.6 
 
 		 229 aa  92.4  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.507959 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0907  condensin subunit ScpB  35.98 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2670  hypothetical protein  37.57 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.801978  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  34.16 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1511  condensin subunit ScpB  39.29 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.340191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4418  condensin subunit ScpB  32.5 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0498  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.48 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2182  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.86 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0881  segregation and condensation protein B  34.1 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2939  condensin subunit ScpB  32.92 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1584  putative transcriptional regulator  32.92 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.459505  normal  0.153015 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0872  segregation and condensation protein B  34.1 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1808  condensin subunit ScpB  34.29 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1486  segregation and condensation protein B  36.09 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.723984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  34.44 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1774  condensin subunit ScpB  36.88 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0954  putative transcriptional regulator  35.23 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1762  putative transcriptional regulator  33.15 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1910  condensin subunit ScpB  36.09 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.954587 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1684  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  35.5 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2346  putative transcriptional regulator  33.94 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.840999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3848  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.76 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000524559  decreased coverage  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1803  chromosome segregation and condensation protein ScpB  31.46 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0823934  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1142  putative transcriptional regulator  31.68 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.463522 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  35.09 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3120  segregation and condensation protein B  37.65 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.121299  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2484  segregation and condensation protein B  37.5 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.429481  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2707  segregation and condensation protein B  38.18 
 
 		 252 aa  72  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3026  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 260 aa  72  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2746  putative transcriptional regulator  30.9 
 
 		 358 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407346  normal  0.450252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2512  putative transcriptional regulator  31.46 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.915644  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  28.93 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2791  chromosome segregation and condensation protein ScpB  30.9 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00825116  normal  0.0347442 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.54 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1162  putative transcriptional regulator  32.18 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170122  normal  0.285603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2908  segregation and condensation protein B  32.5 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0704465 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0875  segregation and condensation protein B  30.63 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  28.72 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  30.63 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  30.63 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.63 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  30.63 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  29.59 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1093  condensin subunit ScpB  32.98 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  30 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  28.57 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  28.57 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  28.57 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3190  segregation and condensation protein B  30 
 
 		 432 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  33.54 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1237  condensin subunit ScpB  33.92 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.818774 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  31.87 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0440  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  33.14 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.112044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  29.11 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.95 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  30.91 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  28.83 
 
 		 349 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1735  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.26 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  34.81 
 
 		 372 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  30.91 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.81 
 
 		 387 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  29.38 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  25.62 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  32.3 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  28.48 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2945  condensin subunit ScpB  30.05 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.0968114 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  25.62 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  29.56 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1689  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.86 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  34.18 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  28.22 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  28.22 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  27.95 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  28.22 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>