More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2817 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1409  short chain dehydrogenase  84.82 
 
 		 257 aa  454  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0200638  normal  0.34398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.82 
 
 		 257 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3055  short chain dehydrogenase  86.77 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1565  short chain dehydrogenase  86.77 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1431  short chain dehydrogenase  86.77 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0631  short chain dehydrogenase  86.77 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0521  short chain dehydrogenase  86.77 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1236  short chain dehydrogenase  86.77 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0250043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1462  short chain dehydrogenase  86.77 
 
 		 257 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.77 
 
 		 257 aa  438  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2817  short chain dehydrogenase  88.33 
 
 		 257 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.96434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0487  short chain dehydrogenase  81.32 
 
 		 257 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.77 
 
 		 257 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2661  short chain dehydrogenase  78.99 
 
 		 257 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0811  short chain dehydrogenase  82.49 
 
 		 271 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2236  short chain dehydrogenase  85.21 
 
 		 257 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2509  short chain dehydrogenase  83.66 
 
 		 257 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5816  short chain dehydrogenase  83.27 
 
 		 257 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1873  short chain dehydrogenase  83.27 
 
 		 257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2533  short chain dehydrogenase  83.66 
 
 		 257 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26310  short chain dehydrogenase  84.44 
 
 		 257 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.29422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2484  short chain dehydrogenase  83.27 
 
 		 257 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2404  short chain dehydrogenase  83.66 
 
 		 257 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0875536  normal  0.494968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.15 
 
 		 257 aa  354  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.37 
 
 		 257 aa  312  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  53.97 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0078  short chain dehydrogenase  53.15 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.71 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.956492  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02490  conserved hypothetical protein  50.7 
 
 		 279 aa  261  6.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.495074  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65964  short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  48.45 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.647739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58869  short-chain dehydrogenase, 2,4- dienoyl-CoA reductase  49.41 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.947206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.67 
 
 		 174 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 250 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.372073  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.97 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 247 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 242 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000101099  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  30.92 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.99 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.63 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 247 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 247 aa  125  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.49 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.59964 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.91 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.59 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  32.94 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 296 aa  118  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.912792 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  30.92 
 
 		 264 aa  118  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.75 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.37 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.73 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.75 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>