More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2043 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2043  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  610  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1960  alpha/beta fold family hydrolase  52.1 
 
 
298 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0277  alpha/beta fold family hydrolase  52.1 
 
 
298 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000662668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0954  alpha/beta fold family hydrolase  52.1 
 
 
298 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0871  alpha/beta fold family hydrolase  52.1 
 
 
298 aa  295  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0997  alpha/beta fold family hydrolase  52.28 
 
 
298 aa  294  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587704  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1158  alpha/beta fold family hydrolase  52.1 
 
 
298 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1004  alpha/beta fold family hydrolase  52.1 
 
 
298 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0801  alpha/beta fold family hydrolase  51.76 
 
 
306 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26480  epoxide hydrolase protein  50.17 
 
 
296 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0777582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2530  alpha/beta hydrolase fold  48.45 
 
 
296 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0814  alpha/beta hydrolase fold  48.45 
 
 
296 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2401  alpha/beta hydrolase fold  48.11 
 
 
296 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.174611  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2506  alpha/beta hydrolase fold  48.97 
 
 
296 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383324  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5813  Alpha/beta hydrolase  48.8 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1870  alpha/beta hydrolase fold  48.63 
 
 
296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2481  alpha/beta hydrolase fold  48.63 
 
 
296 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21950  Alpha/beta hydrolase fold protein  48.15 
 
 
302 aa  269  5e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0666  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 
310 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1145  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 
310 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12150  epoxide hydrolase  44.48 
 
 
296 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 
299 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 
293 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0813  alpha/beta hydrolase fold protein  43.6 
 
 
350 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.875256  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5445  alpha/beta hydrolase fold protein  41.84 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.237342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4005  alpha/beta hydrolase fold  41.34 
 
 
347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.847091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
305 aa  199  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3910  alpha/beta hydrolase fold  42.61 
 
 
348 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.990373  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
345 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5726  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7159  alpha/beta family hydrolase  38.23 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2274  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
293 aa  195  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.302124  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5052  putative epoxide hydrolase  39.93 
 
 
352 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.905889 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6270  alpha/beta hydrolase fold protein  41.05 
 
 
340 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.882285  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4736  twin-arginine translocation pathway signal  38.3 
 
 
350 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.874763  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0075  twin-arginine translocation pathway signal  41.2 
 
 
350 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1437  alpha/beta hydrolase fold protein  38.75 
 
 
305 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130754  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3842  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
347 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
344 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0519  alpha/beta hydrolase fold  39.44 
 
 
341 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0326  alpha/beta hydrolase fold  39.16 
 
 
336 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2255  Alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
347 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257124  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2386  Alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
354 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250689  unclonable  0.0000387671 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4572  alpha/beta hydrolase fold  41.4 
 
 
349 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4231  alpha/beta hydrolase fold protein  38.87 
 
 
364 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0282585  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2518  alpha/beta hydrolase fold protein  39.44 
 
 
337 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2254  epoxide hydrolase  39.58 
 
 
347 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1702  alpha/beta hydrolase fold protein  37.54 
 
 
307 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6173  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
343 aa  185  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6177  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2631  Alpha/beta hydrolase  37.19 
 
 
347 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3508  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3572  alpha/beta hydrolase fold  39.01 
 
 
346 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126926  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2900  Alpha/beta hydrolase  38.64 
 
 
347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4010  alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 
347 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.719713 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5444  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 
356 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  38.95 
 
 
349 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.491211  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1119  alpha/beta family hydrolase  41.55 
 
 
348 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5265  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
346 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3444  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
346 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7153  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 
350 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2687  putative epoxide hydrolase  37.23 
 
 
305 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00230666  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5546  alpha/beta hydrolase fold  38.36 
 
 
346 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0934865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5144  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
347 aa  175  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3921  alpha/beta hydrolase fold protein  39.79 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5035  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 
347 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6836  alpha/beta hydrolase fold protein  38.16 
 
 
345 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230039  normal  0.229752 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3067  alpha/beta fold family hydrolase  39.22 
 
 
456 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1740  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 
308 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5036  alpha/beta hydrolase fold protein  37.23 
 
 
341 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.071455  normal  0.316179 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1295  epoxide hydrolase  39.22 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2941  alpha/beta fold family hydrolase  39.22 
 
 
444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.743767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
305 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
287 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540254  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  29.59 
 
 
315 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
315 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  27.8 
 
 
316 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1579  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
287 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0299453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1381  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  30.31 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
307 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3055  Alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4316  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.311212 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4086  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339898  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 
315 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4162  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.573182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>