36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1424 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  34.03 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  39.78 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  39.78 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  32.35 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  45.21 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  42.47 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  39.56 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  36.17 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  30.95 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  35.96 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  46.3 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  39.73 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  34.83 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  33.7 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  41.33 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  46.15 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  31.19 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  40.28 
 
 		 213 aa  57  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  35.29 
 
 		 212 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2134  restriction endonuclease-like protein  34.95 
 
 		 431 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  35.14 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  45 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  29.67 
 
 		 314 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  34.41 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  25.33 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  30.7 
 
 		 426 aa  46.2  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  41.54 
 
 		 585 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  34.62 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  32.61 
 
 		 240 aa  42.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>