More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1271 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1271  catalase domain-containing protein  100 
 
 
372 aa  760    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0226088 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0174  Catalase domain protein  58.99 
 
 
370 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183386  normal  0.109329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4410  catalase domain-containing protein  59.09 
 
 
366 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.323148  normal  0.136255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0230  catalase domain-containing protein  58.52 
 
 
357 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0297  Catalase domain protein  59.54 
 
 
370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.763403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4983  Catalase domain protein  51.64 
 
 
362 aa  362  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0354975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1668  putative catalase  53.41 
 
 
363 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.096629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1539  Catalase domain protein  51.66 
 
 
368 aa  346  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.815586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2390  catalase domain-containing protein  47.66 
 
 
348 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0072  catalase  47.6 
 
 
361 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.942673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0007  catalase domain-containing protein  47.45 
 
 
363 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00847124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0015  catalase domain-containing protein  47.45 
 
 
363 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000285009  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0085  putative chaperone protein  48.19 
 
 
361 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0006  catalase domain-containing protein  48.25 
 
 
363 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0218273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2887  catalase domain protein  47.8 
 
 
350 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0493344  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0295  catalase  48.19 
 
 
361 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000352146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0085  putative catalase  48.19 
 
 
361 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0720328  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2895  catalase domain-containing protein  48.25 
 
 
350 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.729328  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0031  catalase domain-containing protein  46.69 
 
 
361 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000121953  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2803  catalase domain-containing protein  46.92 
 
 
350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618516  normal  0.283319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3665  catalase-like  46.48 
 
 
364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0012522  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0061  catalase-like  46.69 
 
 
361 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000110872  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0010  catalase domain-containing protein  46.69 
 
 
361 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000429643  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3196  catalase-like  47.48 
 
 
364 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919832  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4645  catalase domain-containing protein  43.61 
 
 
361 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0260  Catalase domain protein  43.91 
 
 
367 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02864  catalase  44.61 
 
 
363 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6722  Catalase domain protein  46.06 
 
 
353 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5484  putative catalase  44.63 
 
 
353 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3458  putative catalase  46.7 
 
 
353 aa  276  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3173  catalase domain-containing protein  39.63 
 
 
365 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0198866 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4987  catalase-like  40.13 
 
 
351 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47920  Catalase protein  40.26 
 
 
335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0523  catalase, N-terminal  37.99 
 
 
332 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2620  putative catalase  34.19 
 
 
365 aa  206  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.717058 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2053  catalase domain-containing protein  37.26 
 
 
329 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.427351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4379  catalase  35.45 
 
 
353 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.120884 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5946  catalase domain-containing protein  37.05 
 
 
330 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1580  putative catalase  33.13 
 
 
338 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.970658  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6547  Catalase domain protein  36.06 
 
 
329 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6719  catalase, protein srpA precursor  34.95 
 
 
326 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2589  Catalase domain protein  35.97 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.603701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2314  catalase domain-containing protein  35.64 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0818212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0995  catalase domain-containing protein  36.51 
 
 
330 aa  172  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1888  catalase domain-containing protein  36.96 
 
 
328 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.166921  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2091  Catalase domain protein  33.33 
 
 
332 aa  156  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3328  putative catalase  29.61 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0243326  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3566  catalase domain-containing protein  32.03 
 
 
329 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2572  catalase-like protein  33.44 
 
 
332 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7513  catalase-like  31.92 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  32.53 
 
 
331 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2683  catalase domain-containing protein  31.29 
 
 
332 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.240925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2517  catalase domain-containing protein  30.61 
 
 
332 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0092954 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4923  catalase domain-containing protein  31.34 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2585  catalase domain-containing protein  30.61 
 
 
332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0569066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1472  catalase domain-containing protein  30.64 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.945508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2365  catalase-like  30.92 
 
 
345 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.102938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1572  catalase domain-containing protein  31.03 
 
 
335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2771  Catalase domain protein  31.03 
 
 
335 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.897516  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1606  catalase domain-containing protein  30.45 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1577  catalase domain-containing protein  29.76 
 
 
335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0750  catalase-like protein  28.77 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4343  catalase domain-containing protein  31.29 
 
 
303 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  28.35 
 
 
485 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1649  catalase  28 
 
 
555 aa  97.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0672008  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  27.27 
 
 
507 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  28.95 
 
 
710 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0449  Catalase  26.95 
 
 
485 aa  93.2  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  29.27 
 
 
710 aa  93.2  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  29.61 
 
 
693 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2465  Catalase  28.04 
 
 
485 aa  92  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.864013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0115  hydroperoxidase II  29.35 
 
 
711 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.368429  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  26.84 
 
 
510 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3637  Catalase  26.84 
 
 
493 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155654  decreased coverage  0.00459164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  30.16 
 
 
702 aa  90.9  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  26.33 
 
 
510 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  30.16 
 
 
702 aa  90.9  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  28.52 
 
 
705 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22418  catalase  28.72 
 
 
566 aa  90.5  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  26.14 
 
 
504 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  27.11 
 
 
555 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2321  catalase  27.19 
 
 
501 aa  90.5  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  26.65 
 
 
507 aa  89.4  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0130  hydroperoxidase II  29.03 
 
 
711 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.333336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20430  catalase  27.76 
 
 
499 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.678559  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0132  hydroperoxidase II  29.03 
 
 
711 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  25.71 
 
 
513 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3115  hydroperoxidase II  30.49 
 
 
708 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1340  hydroperoxidase II  30.49 
 
 
708 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  25.96 
 
 
529 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  29.7 
 
 
694 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2991  hydroperoxidase II  30.49 
 
 
708 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112637  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  26.33 
 
 
543 aa  87.4  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5113  hydroperoxidase II  28.71 
 
 
714 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.417353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3162  catalase  29.84 
 
 
801 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271055  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2377  hydroperoxidase II  27.96 
 
 
712 aa  87  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1646  Catalase  28.2 
 
 
684 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.678634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  25.66 
 
 
529 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  27.87 
 
 
695 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0830  catalase  27.41 
 
 
480 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>