More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12340 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12340  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  100 
 
 		 259 aa  512  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  38.72 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  41.25 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  37.96 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  40.34 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  45.75 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0479  Silent information regulator protein Sir2  42.15 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  36.73 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  38.27 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  39.66 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  40.58 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  36.73 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  39.91 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  37.34 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  37.87 
 
 		 230 aa  129  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  39.83 
 
 		 232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  41.2 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  31.25 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  37.92 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  36.63 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  38.72 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  41.74 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3226  NAD-dependent deacetylase  40.17 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3964  NAD-dependent deacetylase  40.17 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  40.08 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  35.19 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  37.5 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  38.5 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  35.44 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  36.63 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  37.66 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  40.51 
 
 		 250 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  39.23 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  34.65 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  34.66 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  41 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  38.57 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  34.33 
 
 		 259 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  36.67 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  38.27 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  33.65 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  34.15 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  39.81 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  39.07 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  38.46 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  33.47 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  35.27 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  38.24 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  38.89 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  37.55 
 
 		 237 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  36.15 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  37.79 
 
 		 253 aa  112  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  36.65 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  34.09 
 
 		 243 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  36.79 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  40.28 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  34.15 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  34.13 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  34.58 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  36.65 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  37.1 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  35.02 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  31.17 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  36.36 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  31.17 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  37.96 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  38.39 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  34.76 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  34.43 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  38.86 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  33.05 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  36.57 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  36.62 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  35.12 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  33.05 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  33.05 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  37.97 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  37.19 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  34.89 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  36.2 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  34.43 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  39.83 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  40.18 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  36.92 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  32.64 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  33.75 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  33.75 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  33.75 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  33.75 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  33.75 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  31.94 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  35.09 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  34.47 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  35 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  35.1 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>