More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2549 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2549  alanine racemase domain-containing protein  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0648095  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3945  hypothetical protein  82.59 
 
 
224 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00244748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3952  conserved hypothetical protein TIGR00044  82.59 
 
 
224 aa  388  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000844629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4001  conserved hypothetical protein TIGR00044  82.59 
 
 
224 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000153868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1240  hypothetical protein  82.59 
 
 
224 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000730166  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3751  hypothetical protein  81.7 
 
 
224 aa  384  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0252212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3642  hypothetical protein  81.7 
 
 
224 aa  384  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000487745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4039  hypothetical protein  81.7 
 
 
224 aa  384  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00228319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3914  conserved hypothetical protein TIGR00044  81.7 
 
 
224 aa  384  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000064891 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3659  hypothetical protein  81.7 
 
 
224 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000235799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3727  hypothetical protein  80.8 
 
 
224 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1034  alanine racemase domain protein  60.99 
 
 
226 aa  302  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000216914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1904  alanine racemase domain protein  60.36 
 
 
224 aa  293  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1272  alanine racemase domain-containing protein  55 
 
 
222 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000279227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1247  alanine racemase domain-containing protein  55 
 
 
222 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000447038  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0753  hypothetical protein  51.35 
 
 
222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.174095  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2061  TIM-barrel fold family protein  48.86 
 
 
225 aa  211  7.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0778  hypothetical protein  46.12 
 
 
227 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.234851  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0480  ylmE protein, putative  43.38 
 
 
224 aa  201  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  43.3 
 
 
234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  43.11 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  42.22 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  40 
 
 
244 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  42.41 
 
 
229 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  42.41 
 
 
229 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  41.59 
 
 
230 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  41.15 
 
 
230 aa  169  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  40.44 
 
 
228 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  40.09 
 
 
231 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  41.63 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  41.59 
 
 
236 aa  165  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  41.78 
 
 
234 aa  165  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  39.56 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  40.27 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2306  hypothetical protein  38.91 
 
 
271 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  40.18 
 
 
227 aa  161  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  40.82 
 
 
202 aa  161  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1487  hypothetical protein  39.91 
 
 
240 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.164906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0906  alanine racemase domain protein  39.21 
 
 
241 aa  159  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.248468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 
229 aa  158  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4138  alanine racemase domain-containing protein  38.29 
 
 
276 aa  157  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  38.43 
 
 
235 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  38.5 
 
 
228 aa  155  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  39.38 
 
 
231 aa  154  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  37 
 
 
233 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2737  alanine racemase domain protein  38.29 
 
 
259 aa  153  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  37.84 
 
 
275 aa  152  4e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  38.29 
 
 
271 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2383  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 
257 aa  151  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  38.01 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  38.71 
 
 
228 aa  150  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  39.11 
 
 
244 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1779  alanine racemase domain protein  40.36 
 
 
229 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  37.17 
 
 
237 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  40.71 
 
 
231 aa  148  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.74 
 
 
224 aa  149  5e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  38.33 
 
 
248 aa  148  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  37.61 
 
 
228 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  36.2 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  36.96 
 
 
230 aa  145  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0550  alanine racemase domain protein  39.8 
 
 
219 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1294  alanine racemase domain protein  39.01 
 
 
229 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  37.55 
 
 
234 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  34.51 
 
 
233 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  33.93 
 
 
233 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 
228 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1350  hypothetical protein  37.44 
 
 
229 aa  141  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4019  alanine racemase domain protein  37.05 
 
 
270 aa  141  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.69419  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1237  hypothetical protein  36.44 
 
 
261 aa  141  9e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1116  alanine racemase domain protein  39.22 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0312206  normal  0.913907 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  33.33 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3839  alanine racemase domain protein  37.05 
 
 
280 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4212  alanine racemase domain-containing protein  35.87 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0294103  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1789  alanine racemase domain protein  36.73 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259627  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  36.44 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.67 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  37.12 
 
 
229 aa  138  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  33.19 
 
 
237 aa  138  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1694  alanine racemase domain protein  38.61 
 
 
224 aa  138  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3449  alanine racemase domain-containing protein  34.8 
 
 
219 aa  138  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  34.2 
 
 
235 aa  137  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1713  alanine racemase domain protein  38.61 
 
 
224 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0268832  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  33.91 
 
 
236 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1802  alanine racemase domain protein  36.56 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2011  alanine racemase domain protein  34.51 
 
 
220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  34.38 
 
 
235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1822  hypothetical protein  39.5 
 
 
219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000058196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  34.51 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  35.71 
 
 
242 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  36.5 
 
 
213 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  35.5 
 
 
228 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0984  alanine racemase domain protein  37.78 
 
 
271 aa  135  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  34.36 
 
 
218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1145  alanine racemase domain-containing protein  35.11 
 
 
261 aa  134  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  32.23 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  33.48 
 
 
237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  36.14 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2937  hypothetical protein  35.84 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  32.46 
 
 
238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2190  hypothetical cytosolic protein  34.07 
 
 
228 aa  133  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.724398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>